More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1759 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.27 
 
 		 379 aa  652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.19 
 
 		 377 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  82.93 
 
 		 377 aa  671    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 377 aa  785    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.53 
 
 		 376 aa  624  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.21 
 
 		 377 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.88 
 
 		 379 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.18 
 
 		 376 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.26 
 
 		 375 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.81 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.45 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.23 
 
 		 376 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.51 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.41 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.8 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.83 
 
 		 379 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  52.29 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.55 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.87 
 
 		 376 aa  401  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.47 
 
 		 371 aa  401  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.02 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.49 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.75 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 379 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.79 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 379 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.19 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 		 372 aa  393  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.38 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.38 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.6 
 
 		 376 aa  391  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 		 367 aa  388  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.73 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.05 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.12 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.26 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.6 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.32 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.93 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 		 386 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.2 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.8 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.19 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.88 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.04 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0133  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.25 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.85 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.64 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.55 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.44 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.48 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>