More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1912 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
380 aa  795    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
380 aa  795    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.24 
 
 
378 aa  621  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.29 
 
 
375 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.76 
 
 
384 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 
373 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 
370 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.12 
 
 
367 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.18 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.94 
 
 
368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.91 
 
 
374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.3 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.41 
 
 
380 aa  401  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.19 
 
 
369 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 
369 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.94 
 
 
372 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.7 
 
 
370 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.25 
 
 
380 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
370 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
368 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 
373 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.21 
 
 
372 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.34 
 
 
368 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.67 
 
 
380 aa  391  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
367 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
374 aa  391  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
379 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
374 aa  391  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.73 
 
 
379 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.32 
 
 
379 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.32 
 
 
379 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.92 
 
 
392 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
377 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.73 
 
 
379 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
379 aa  391  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.8 
 
 
382 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.06 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.06 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.06 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.06 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.06 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.06 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
372 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.66 
 
 
373 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
376 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
377 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.06 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
377 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.32 
 
 
379 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.67 
 
 
387 aa  389  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.92 
 
 
357 aa  388  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
374 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
374 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.4 
 
 
370 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
374 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  50 
 
 
382 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 
380 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.34 
 
 
376 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 
379 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.04 
 
 
379 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.34 
 
 
376 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.07 
 
 
374 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.07 
 
 
374 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.07 
 
 
374 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
378 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
374 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 
373 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
374 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
376 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
370 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 
371 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
387 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
369 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
374 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 
375 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.9 
 
 
371 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.91 
 
 
387 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
382 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
368 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 
376 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
371 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
377 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1307  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.44 
 
 
387 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.8 
 
 
377 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
371 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
369 aa  378  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
371 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
380 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
381 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 
368 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.18 
 
 
387 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
376 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>