196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1308 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1308  FO synthase subunit 2  100 
 
 
454 aa  921    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2637  Radical SAM domain protein  73.86 
 
 
459 aa  638    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0645  Radical SAM domain protein  73.83 
 
 
459 aa  657    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1418  FO synthase subunit 2  76.27 
 
 
451 aa  699    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2018  FO synthase subunit 2  69.68 
 
 
482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.595846 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  39.9 
 
 
366 aa  257  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 
367 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  37.12 
 
 
359 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  37.12 
 
 
370 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  36.99 
 
 
364 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  37.69 
 
 
361 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  38.17 
 
 
362 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  38.07 
 
 
841 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 
365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  37.12 
 
 
359 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  39.84 
 
 
800 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  35.41 
 
 
359 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 
362 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  34.14 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  36.57 
 
 
361 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  34.67 
 
 
871 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 
859 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  32.99 
 
 
384 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  37.19 
 
 
859 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.29 
 
 
863 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  37.67 
 
 
792 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  36.36 
 
 
856 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  36.76 
 
 
820 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  33.92 
 
 
867 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  35.83 
 
 
859 aa  206  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  35.15 
 
 
859 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  35.81 
 
 
859 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  35.81 
 
 
859 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 
419 aa  203  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 
355 aa  203  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 
881 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.22 
 
 
875 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.51 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  35.68 
 
 
418 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  34.67 
 
 
944 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  34.08 
 
 
857 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  36.91 
 
 
826 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  32.79 
 
 
358 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.14 
 
 
737 aa  199  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  34.42 
 
 
358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.9 
 
 
741 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 
358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  35.79 
 
 
841 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  34.7 
 
 
779 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  37.17 
 
 
435 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  34.68 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  33.87 
 
 
429 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  34.41 
 
 
899 aa  196  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.41 
 
 
737 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.03 
 
 
872 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  33.17 
 
 
860 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  33 
 
 
842 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  33.83 
 
 
368 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  33.33 
 
 
356 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  34.64 
 
 
838 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 
757 aa  190  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 
368 aa  190  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  33.65 
 
 
884 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  34.77 
 
 
358 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  34.63 
 
 
358 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  33.83 
 
 
836 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 
367 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  32.58 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  31.78 
 
 
384 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  32.03 
 
 
384 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  33.17 
 
 
381 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 
359 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  32.59 
 
 
355 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 
358 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 
356 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 
358 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  30.94 
 
 
356 aa  180  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  31.91 
 
 
852 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 
367 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 
359 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
354 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  32.85 
 
 
386 aa  176  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 
360 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 
365 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  31.98 
 
 
373 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  32.71 
 
 
386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  32.91 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  32.61 
 
 
398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 
354 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  32.35 
 
 
391 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 
626 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  33.61 
 
 
361 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 
626 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
373 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  32.68 
 
 
626 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 
375 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  32.1 
 
 
376 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
372 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>