195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2018 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1418  FO synthase subunit 2  72.28 
 
 		 451 aa  665    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0645  Radical SAM domain protein  72.92 
 
 		 459 aa  666    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2637  Radical SAM domain protein  70.8 
 
 		 459 aa  636    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2018  FO synthase subunit 2  100 
 
 		 482 aa  984    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.595846 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1308  FO synthase subunit 2  68.92 
 
 		 454 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 		 367 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  38.52 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  38.74 
 
 		 370 aa  240  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  38.61 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  39.17 
 
 		 359 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  37.19 
 
 		 362 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  37.29 
 
 		 859 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  36.63 
 
 		 856 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  38.02 
 
 		 800 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 419 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  36.11 
 
 		 362 aa  226  7e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  38.12 
 
 		 859 aa  226  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  36.11 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  36.82 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 881 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  37.5 
 
 		 859 aa  223  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  36.29 
 
 		 842 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.38 
 
 		 863 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  37.06 
 
 		 859 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  37.06 
 
 		 859 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  37.06 
 
 		 859 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  35.28 
 
 		 867 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  36.16 
 
 		 841 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  36.76 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.4 
 
 		 872 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  36.16 
 
 		 944 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 362 aa  217  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  36.96 
 
 		 364 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  33.25 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.85 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  36.55 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  34.67 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  35.77 
 
 		 871 aa  213  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  36.02 
 
 		 899 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  35.68 
 
 		 376 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  34.55 
 
 		 852 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  34.94 
 
 		 368 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  35.64 
 
 		 826 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  33.33 
 
 		 792 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  36.19 
 
 		 358 aa  208  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  35.01 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  34.16 
 
 		 841 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  35.35 
 
 		 860 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.78 
 
 		 875 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  34.66 
 
 		 857 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  34.84 
 
 		 429 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.53 
 
 		 737 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 757 aa  205  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.12 
 
 		 741 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  35.86 
 
 		 836 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.78 
 
 		 737 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  31.28 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  33.33 
 
 		 779 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  35.99 
 
 		 838 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  33.58 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  32.69 
 
 		 358 aa  199  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  33.5 
 
 		 381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  33.82 
 
 		 820 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  35.26 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  34.02 
 
 		 884 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  33.09 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 		 368 aa  194  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  35.26 
 
 		 358 aa  193  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 		 355 aa  193  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  32.93 
 
 		 384 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  34.6 
 
 		 356 aa  192  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  33.5 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  32.3 
 
 		 356 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  33.67 
 
 		 355 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  32.18 
 
 		 367 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  33.83 
 
 		 359 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  32.02 
 
 		 386 aa  180  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  32.37 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  30.02 
 
 		 359 aa  176  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  31.46 
 
 		 382 aa  176  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  32.09 
 
 		 398 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  33.84 
 
 		 360 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 354 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  35.4 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 359 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  29.85 
 
 		 356 aa  171  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 365 aa  171  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 626 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 626 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 369 aa  167  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  31.15 
 
 		 345 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  33.42 
 
 		 626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  32.75 
 
 		 362 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  30.79 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>