228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05260 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_05260  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 177 aa  341  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000774964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0588  hypothetical protein  25.93 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1828  hypothetical protein  32.11 
 
 		 198 aa  67  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.58144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  25.49 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  32.89 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  23.65 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  31.03 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  33.98 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  31.03 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 372 aa  54.3  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  24.03 
 
 		 288 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  23.94 
 
 		 288 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  32.46 
 
 		 293 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2210  hypothetical protein  27.91 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  32.46 
 
 		 293 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 801 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  24.28 
 
 		 264 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 479 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  32.11 
 
 		 756 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 282 aa  51.2  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  30.71 
 
 		 280 aa  51.2  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  23.39 
 
 		 871 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 362 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  23.39 
 
 		 864 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  23.85 
 
 		 843 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 278 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  22.58 
 
 		 822 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4456  MscS mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 550 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  22.58 
 
 		 822 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 595 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 261 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  22.58 
 
 		 822 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 289 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  25.52 
 
 		 270 aa  49.3  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  30.68 
 
 		 599 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  21.77 
 
 		 837 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  22.66 
 
 		 821 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  23.85 
 
 		 889 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 335 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  23.85 
 
 		 884 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  27.59 
 
 		 624 aa  48.5  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 304 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 393 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  27.5 
 
 		 505 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 528 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 291 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 528 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 718 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  27.46 
 
 		 633 aa  48.1  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 853 aa  48.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 795 aa  48.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.75 
 
 		 282 aa  48.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  22.73 
 
 		 287 aa  47.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  21.19 
 
 		 753 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 350 aa  47.8  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 275 aa  47.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  22.29 
 
 		 568 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 911 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 766 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 549 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 344 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 362 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  26.06 
 
 		 286 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 762 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  20.25 
 
 		 705 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 338 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  27.78 
 
 		 543 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 773 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  21.12 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  24.27 
 
 		 697 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 		 658 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 707 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  26.88 
 
 		 455 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 772 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.74 
 
 		 366 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 538 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 716 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 485 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  21.89 
 
 		 792 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  29.87 
 
 		 458 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  30.19 
 
 		 767 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 787 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>