More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0588 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  377  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1828  hypothetical protein  57.65 
 
 		 198 aa  201  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.58144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2210  hypothetical protein  61.4 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 445 aa  71.2  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05260  small-conductance mechanosensitive channel  25.93 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000774964  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  33.75 
 
 		 624 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  32.58 
 
 		 633 aa  68.6  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  33.12 
 
 		 682 aa  65.5  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.33 
 
 		 328 aa  62  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  25.81 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 981 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  41.3 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 627 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 849 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  35.23 
 
 		 847 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 847 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 338 aa  58.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  38.14 
 
 		 627 aa  58.5  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  23.46 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  38.14 
 
 		 627 aa  58.5  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 349 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  34.42 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 595 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  28.93 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.28 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  23.93 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  24.31 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 840 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  23.33 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 807 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  28.93 
 
 		 532 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  22.36 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  30.3 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  26.56 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  28.48 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  36.99 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 867 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  28.66 
 
 		 288 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 343 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 327 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  31.18 
 
 		 342 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 		 796 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  23.68 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 327 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 544 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  27.61 
 
 		 563 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 327 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 356 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 296 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  22.67 
 
 		 344 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  27.85 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 359 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  52  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 299 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 433 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4456  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 550 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 360 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0432  small-conductance mechanosensitive channel  27.55 
 
 		 298 aa  52  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000493882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 433 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 431 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  34.04 
 
 		 360 aa  51.6  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 549 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 549 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 549 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1887  MscS Mechanosensitive ion channel  26.57 
 
 		 811 aa  51.6  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.723703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  23.9 
 
 		 282 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 429 aa  51.2  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  28.15 
 
 		 494 aa  51.2  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 693 aa  51.2  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  23.74 
 
 		 289 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 773 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 864 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.83 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  30.68 
 
 		 825 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 362 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 		 372 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 489 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  35.82 
 
 		 329 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  23.78 
 
 		 795 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  23.08 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  22.54 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>