More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3890 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3890  erythronolide synthase  100 
 
 		 765 aa  1490    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000750553  normal  0.261243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  54.23 
 
 		 2126 aa  629  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  52.71 
 
 		 3463 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  54.26 
 
 		 4080 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  55.57 
 
 		 3254 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.06 
 
 		 7210 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51.04 
 
 		 3711 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  51.25 
 
 		 4111 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.5 
 
 		 5400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 		 7110 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  54.27 
 
 		 7279 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  52.58 
 
 		 1548 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  53.63 
 
 		 4840 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  52.94 
 
 		 2277 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  54.52 
 
 		 3408 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  50.37 
 
 		 2108 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  52.78 
 
 		 4151 aa  588  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  53.82 
 
 		 3508 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  53.13 
 
 		 5154 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  54.24 
 
 		 2966 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.93 
 
 		 1816 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  52.96 
 
 		 3158 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.93 
 
 		 1101 aa  588  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.44 
 
 		 3092 aa  585  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  54.94 
 
 		 2367 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  54.18 
 
 		 3670 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  53.54 
 
 		 3355 aa  578  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  55.05 
 
 		 3148 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  52 
 
 		 1601 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.65 
 
 		 3033 aa  572  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  52.5 
 
 		 1602 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  49.35 
 
 		 3449 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  49.65 
 
 		 3494 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  51.15 
 
 		 1924 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.34 
 
 		 1305 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  51.91 
 
 		 2113 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  54.69 
 
 		 2107 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  51.9 
 
 		 6768 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  50.36 
 
 		 5255 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  52.11 
 
 		 1584 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  50.22 
 
 		 1831 aa  558  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  50.08 
 
 		 4882 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.88 
 
 		 1867 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  51.98 
 
 		 4930 aa  552  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  51.85 
 
 		 1593 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  52.29 
 
 		 1789 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  50.99 
 
 		 1143 aa  551  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  48.41 
 
 		 3930 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  48.03 
 
 		 1114 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  49.1 
 
 		 4575 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  48.25 
 
 		 2719 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.71 
 
 		 3493 aa  544  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.14 
 
 		 3874 aa  542  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.06 
 
 		 1126 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  48.79 
 
 		 2847 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  47.36 
 
 		 2066 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  49.71 
 
 		 2090 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  50 
 
 		 2020 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  51.22 
 
 		 2846 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  47.76 
 
 		 2081 aa  526  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  46.86 
 
 		 1955 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.44 
 
 		 2078 aa  524  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  48.78 
 
 		 1071 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  50.61 
 
 		 4607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  48.68 
 
 		 2374 aa  515  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.52 
 
 		 1837 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  49.77 
 
 		 1820 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  48.55 
 
 		 2376 aa  512  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  49.18 
 
 		 2060 aa  502  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  47.6 
 
 		 2024 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12961  polyketide synthase pks15  58.49 
 
 		 496 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.914056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  43.38 
 
 		 3281 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  46.58 
 
 		 1573 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  46.06 
 
 		 4264 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  47.12 
 
 		 1077 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  47.41 
 
 		 3400 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 2551 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  42.81 
 
 		 3693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  42.81 
 
 		 3693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  42.96 
 
 		 3702 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 1874 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  37.17 
 
 		 1587 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.57 
 
 		 4478 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  41.77 
 
 		 1402 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.91 
 
 		 1354 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  42.31 
 
 		 3676 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 		 1812 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  42.11 
 
 		 1822 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.92 
 
 		 2880 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 		 2230 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  41.49 
 
 		 3696 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  42.63 
 
 		 1190 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  42.63 
 
 		 1190 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  55.14 
 
 		 2666 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  42.48 
 
 		 1190 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  42.42 
 
 		 1520 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  42.05 
 
 		 1580 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.97 
 
 		 1559 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  42.42 
 
 		 1520 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  42.05 
 
 		 1580 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>