148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3125 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  907    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  58.89 
 
 
450 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  58.54 
 
 
450 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  58.67 
 
 
450 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  58.44 
 
 
450 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  58.44 
 
 
450 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  57.43 
 
 
451 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  54.81 
 
 
446 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  51.89 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  45.07 
 
 
448 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  41.87 
 
 
449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  35.63 
 
 
447 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  34.74 
 
 
447 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  34.97 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  34.97 
 
 
447 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  35.19 
 
 
447 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  32.89 
 
 
448 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  33.8 
 
 
433 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  44.16 
 
 
276 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  32.27 
 
 
448 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  34.55 
 
 
448 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  34.32 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  34.32 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  34.32 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  34.77 
 
 
448 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  34.77 
 
 
448 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  34.09 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.41 
 
 
448 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  34.55 
 
 
468 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  33.86 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  33.86 
 
 
448 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  33.64 
 
 
448 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  31.69 
 
 
447 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  30.65 
 
 
443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  27.96 
 
 
448 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  27.96 
 
 
448 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  29.74 
 
 
445 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  29.33 
 
 
446 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  26.64 
 
 
444 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  27.19 
 
 
444 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  28.29 
 
 
444 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.8 
 
 
443 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  28.73 
 
 
444 aa  150  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  26.35 
 
 
443 aa  146  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  26.35 
 
 
443 aa  146  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  26.35 
 
 
443 aa  146  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  26.52 
 
 
444 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  28.19 
 
 
444 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  27.03 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  27.03 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  29.71 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  27.48 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.27 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  27.99 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  26.82 
 
 
442 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  26.22 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  26.4 
 
 
443 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  26.97 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.96 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  26.35 
 
 
444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.96 
 
 
445 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  25.5 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.47 
 
 
445 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  26.7 
 
 
442 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  25.5 
 
 
443 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  25.5 
 
 
443 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  24.83 
 
 
443 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  27.99 
 
 
445 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.99 
 
 
449 aa  123  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.99 
 
 
449 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.99 
 
 
449 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  27.77 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  27.09 
 
 
445 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.35 
 
 
447 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  26.92 
 
 
472 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  24.44 
 
 
450 aa  120  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  28.38 
 
 
455 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  26.05 
 
 
441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.14 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.35 
 
 
446 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  26.08 
 
 
468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  26.5 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  25.83 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  26.12 
 
 
444 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  26.07 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  26.07 
 
 
467 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  26.07 
 
 
467 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  26.07 
 
 
467 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  26.07 
 
 
467 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  26.07 
 
 
467 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.6 
 
 
429 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  25.85 
 
 
467 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.67 
 
 
458 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.28 
 
 
447 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  26.86 
 
 
449 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  25.84 
 
 
480 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  24.33 
 
 
448 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  26.07 
 
 
480 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  26.07 
 
 
449 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  26.07 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>