155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2629 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  99.78 
 
 		 447 aa  916    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  86.35 
 
 		 447 aa  823    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  98.21 
 
 		 447 aa  905    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  97.54 
 
 		 447 aa  898    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  917    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  63.84 
 
 		 448 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  41.03 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  41.16 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  40.94 
 
 		 448 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  40.72 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  40.72 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  41.16 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  41.16 
 
 		 448 aa  329  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  40.72 
 
 		 448 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  40.72 
 
 		 448 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  40.72 
 
 		 448 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  40.27 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  41.76 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  41.39 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  40.49 
 
 		 468 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  40.49 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  40.49 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  37.98 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  45.42 
 
 		 276 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  36.14 
 
 		 451 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  33.11 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  34.97 
 
 		 445 aa  249  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  32.89 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  32.89 
 
 		 450 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  32.14 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  34.15 
 
 		 446 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  31.11 
 
 		 446 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  28.6 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  29.19 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  30.89 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  30.44 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  30.67 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  29.49 
 
 		 444 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.17 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.17 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  26.99 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  26.5 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  26.16 
 
 		 443 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  26.16 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  26.16 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  25.84 
 
 		 442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.3 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  28.1 
 
 		 444 aa  163  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  28.82 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.82 
 
 		 445 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  27.49 
 
 		 443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  26.89 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.06 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  28.27 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  29.41 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  27.13 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  28.7 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  28.73 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  27.05 
 
 		 448 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  27.05 
 
 		 448 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  25.84 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  27.07 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  28.22 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  27.84 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  27.07 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.33 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  25.77 
 
 		 443 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  25.77 
 
 		 443 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.35 
 
 		 458 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.37 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  27.81 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  26.48 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  28.02 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.9 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.65 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.65 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.65 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  28.57 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  28.57 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  28.57 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  28.57 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  28.57 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  28.35 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  28.29 
 
 		 468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  25.95 
 
 		 443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  26.67 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  23.44 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  26.83 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  26.83 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  26.83 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  26.32 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  22.99 
 
 		 441 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  26.61 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  26.7 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  26.81 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.61 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.41 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>