152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01968 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  910    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  73.66 
 
 		 448 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  71.88 
 
 		 448 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  71.88 
 
 		 448 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  73.21 
 
 		 448 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  71.88 
 
 		 448 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  71.65 
 
 		 448 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  71.88 
 
 		 448 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  73.44 
 
 		 448 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  73.88 
 
 		 468 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  73.66 
 
 		 448 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  71.43 
 
 		 448 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  71.65 
 
 		 448 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  60.37 
 
 		 433 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  56.76 
 
 		 447 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  42.06 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  41.16 
 
 		 447 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  41.16 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  41.39 
 
 		 447 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  41.16 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  39.96 
 
 		 448 aa  336  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  38.18 
 
 		 448 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  36.63 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  33.71 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  33.86 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  33.63 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  33.63 
 
 		 450 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  33.63 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  42.65 
 
 		 276 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  33.11 
 
 		 446 aa  226  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  32.27 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  34.08 
 
 		 451 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  28.54 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  29.57 
 
 		 449 aa  186  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  28.67 
 
 		 443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  29.18 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  29.65 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.78 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  30.7 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.05 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  30.23 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  27.59 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  26.23 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  28.51 
 
 		 443 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  30.48 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  28.89 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  26.35 
 
 		 443 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  26.58 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  26.58 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  27.94 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.01 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.02 
 
 		 447 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  28.38 
 
 		 448 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  28.13 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  24.89 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.88 
 
 		 446 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  26.52 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  25.9 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  25.9 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  27.68 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  27.68 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  27.68 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.62 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.62 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.62 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  26.49 
 
 		 445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  29.08 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.17 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.94 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.17 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  25.39 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  25.39 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  25.94 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  25.95 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  27.71 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  26.7 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  25.51 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  25.39 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  27.51 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  27.29 
 
 		 468 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  27.29 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  23.88 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  26.61 
 
 		 448 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  25.27 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  27.65 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.33 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  26.05 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  26.87 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  26.39 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  23.69 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  26.16 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  26.16 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  26.16 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  26.16 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  26.16 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>