152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02042 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  884    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  60.37 
 
 
448 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  58.53 
 
 
448 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  58.06 
 
 
448 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  57.83 
 
 
448 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  57.6 
 
 
448 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  57.14 
 
 
448 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  57.6 
 
 
448 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  57.6 
 
 
448 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  57.14 
 
 
448 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  58.53 
 
 
448 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  57.37 
 
 
448 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  58.53 
 
 
468 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  58.53 
 
 
448 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  52.42 
 
 
447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  42.23 
 
 
447 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  42.46 
 
 
447 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  39.35 
 
 
448 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  41.76 
 
 
447 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  42 
 
 
447 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  41.76 
 
 
447 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  40.78 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  37.56 
 
 
449 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  35.02 
 
 
450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  34.56 
 
 
450 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  34.17 
 
 
450 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  34.33 
 
 
450 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  34.93 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  38.01 
 
 
451 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  43.38 
 
 
276 aa  230  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  35.42 
 
 
446 aa  226  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  34.14 
 
 
445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  29.59 
 
 
449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  26.88 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  30.28 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  30.05 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  27.44 
 
 
444 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  27.19 
 
 
443 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  27.21 
 
 
448 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  27.21 
 
 
448 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  27.74 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  27 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  27.42 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  27.42 
 
 
443 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.25 
 
 
446 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  27.98 
 
 
443 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  27.98 
 
 
443 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  25.06 
 
 
444 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  29.62 
 
 
445 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.23 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  27.5 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  28.41 
 
 
444 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  27.5 
 
 
443 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  25.58 
 
 
442 aa  153  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.5 
 
 
445 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  27.73 
 
 
445 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.27 
 
 
445 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  28.7 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.61 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  27.17 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  26.9 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.82 
 
 
445 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  26.94 
 
 
443 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  27.63 
 
 
445 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  27.29 
 
 
443 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  28.67 
 
 
444 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  28.08 
 
 
449 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  28.08 
 
 
449 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  28.08 
 
 
449 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.7 
 
 
447 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  27.06 
 
 
443 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  28.08 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  28.15 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  27.85 
 
 
445 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  25.06 
 
 
445 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  27.85 
 
 
450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  26.77 
 
 
448 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  25.85 
 
 
448 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  26.61 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.2 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.77 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.29 
 
 
458 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  23.8 
 
 
441 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  24.71 
 
 
440 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  24.67 
 
 
463 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  23.8 
 
 
441 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  26.77 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  26.77 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  26.77 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  26.77 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  26.77 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  26.77 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  26.77 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  25 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  26.94 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  26.94 
 
 
452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  21.72 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  25.77 
 
 
454 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  26.94 
 
 
449 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  26.15 
 
 
467 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>