150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0165 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  885    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  30.94 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  27.13 
 
 
447 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  27.13 
 
 
447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  27.35 
 
 
447 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  27.13 
 
 
447 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  26.77 
 
 
447 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  25.51 
 
 
448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  29.45 
 
 
448 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  30.49 
 
 
444 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  27.62 
 
 
448 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  26.95 
 
 
448 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  27.17 
 
 
448 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  27.17 
 
 
448 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  27.35 
 
 
447 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  26.73 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  26.73 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  26.73 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  25.95 
 
 
443 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  26.4 
 
 
443 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  27.69 
 
 
443 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  28.88 
 
 
448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  27.85 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.5 
 
 
448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.97 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.97 
 
 
443 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  29.53 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  26.12 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  25.45 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  24.33 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  26.56 
 
 
468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  29.17 
 
 
446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  26.56 
 
 
444 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  26.56 
 
 
448 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  26.56 
 
 
448 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.01 
 
 
446 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.03 
 
 
447 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  27.72 
 
 
450 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  26.79 
 
 
448 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  24.05 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  27.29 
 
 
450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  24.61 
 
 
448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  24.61 
 
 
448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  27.74 
 
 
444 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  27.29 
 
 
450 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  27.29 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  27.74 
 
 
444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  24.61 
 
 
443 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  28.12 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.8 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  24.61 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  24.61 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.21 
 
 
445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.35 
 
 
445 aa  117  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  26.34 
 
 
445 aa  116  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.48 
 
 
458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.8 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  26.81 
 
 
450 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  26.43 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  24.78 
 
 
445 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  29.46 
 
 
455 aa  113  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  23.5 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  26.75 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  27.11 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  27.23 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  26.75 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  26.75 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  26.75 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  27.11 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  27.11 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  25.17 
 
 
445 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  26.95 
 
 
444 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  26.27 
 
 
443 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  26.75 
 
 
448 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  26.55 
 
 
448 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  26.75 
 
 
448 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  25.39 
 
 
445 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.17 
 
 
443 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.28 
 
 
447 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  26.54 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  25.39 
 
 
445 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  26.39 
 
 
447 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  26.39 
 
 
447 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  26.39 
 
 
447 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  26.39 
 
 
447 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  25.43 
 
 
448 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  27.59 
 
 
468 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  27.91 
 
 
467 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  27.91 
 
 
467 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  27.91 
 
 
467 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  27.91 
 
 
467 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  27.91 
 
 
467 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  27.91 
 
 
467 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  27.66 
 
 
454 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  24.44 
 
 
445 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  25.5 
 
 
447 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  24.16 
 
 
443 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  24.16 
 
 
443 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.11 
 
 
429 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  24.52 
 
 
448 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>