154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4910 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  73.44 
 
 
448 aa  696    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  91.52 
 
 
448 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  87.5 
 
 
448 aa  820    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  89.06 
 
 
448 aa  830    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  91.07 
 
 
448 aa  844    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  88.39 
 
 
448 aa  824    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  88.84 
 
 
448 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  88.39 
 
 
448 aa  824    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  89.06 
 
 
448 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  91.52 
 
 
468 aa  826    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  88.39 
 
 
448 aa  824    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  91.52 
 
 
448 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  100 
 
 
448 aa  912    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  58.06 
 
 
433 aa  524  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  56.08 
 
 
447 aa  503  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  42.67 
 
 
447 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  40.94 
 
 
447 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  41.16 
 
 
447 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  41.16 
 
 
447 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  41.16 
 
 
447 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  39.06 
 
 
448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  36.2 
 
 
448 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  34.68 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  32.28 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  32.21 
 
 
450 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  32.96 
 
 
450 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  40.44 
 
 
276 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  32.21 
 
 
450 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  32.21 
 
 
450 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  33.56 
 
 
446 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  31.24 
 
 
443 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  32.73 
 
 
445 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  34.08 
 
 
451 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  29.49 
 
 
443 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  30.25 
 
 
444 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  30.02 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  29.85 
 
 
446 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.38 
 
 
443 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  26.85 
 
 
442 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  28.04 
 
 
444 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  28.82 
 
 
444 aa  166  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.25 
 
 
446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  28.7 
 
 
444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  27.02 
 
 
444 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  25.94 
 
 
445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  28.73 
 
 
444 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  26.58 
 
 
443 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  26.3 
 
 
444 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.44 
 
 
445 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  25.5 
 
 
442 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  28.15 
 
 
449 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.63 
 
 
446 aa  159  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  28.82 
 
 
467 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  28.82 
 
 
454 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  28.82 
 
 
467 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  28.82 
 
 
467 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  28.82 
 
 
467 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  28.82 
 
 
467 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  25.9 
 
 
443 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  25.9 
 
 
443 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.17 
 
 
447 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  28.6 
 
 
467 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  28.11 
 
 
445 aa  156  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.06 
 
 
445 aa  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  25.9 
 
 
443 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  25.9 
 
 
443 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.06 
 
 
445 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.5 
 
 
443 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  27.51 
 
 
468 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  28.6 
 
 
472 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  28.16 
 
 
443 aa  150  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  27.78 
 
 
444 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  27.96 
 
 
455 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.61 
 
 
445 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  26.39 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.28 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  25 
 
 
448 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  26.33 
 
 
445 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  25 
 
 
448 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  26.99 
 
 
448 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  27.05 
 
 
443 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.89 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  27.18 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.86 
 
 
464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  25.36 
 
 
440 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  25.5 
 
 
450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.49 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.32 
 
 
429 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  26.37 
 
 
445 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.94 
 
 
447 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  25.49 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  25.49 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  25.49 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  24.62 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  27.31 
 
 
448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  26.77 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  24.35 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  26.55 
 
 
448 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  26.99 
 
 
447 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  26.59 
 
 
445 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>