153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2264 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  918    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  64.51 
 
 
447 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  64.51 
 
 
447 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  64.06 
 
 
447 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  63.39 
 
 
447 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  63.84 
 
 
447 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  39.96 
 
 
448 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  38.98 
 
 
448 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  39.35 
 
 
433 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  38.75 
 
 
448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  38.75 
 
 
448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  39.06 
 
 
448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  38.98 
 
 
448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  39.11 
 
 
448 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  38.53 
 
 
448 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  38.53 
 
 
448 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  38.53 
 
 
448 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  38.03 
 
 
448 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  39.56 
 
 
448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  39.56 
 
 
448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  39.33 
 
 
468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  39.11 
 
 
449 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  36.47 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  43.8 
 
 
276 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  33.7 
 
 
450 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  33.26 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  33.04 
 
 
450 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  33.04 
 
 
450 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  33.7 
 
 
450 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  32.89 
 
 
445 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  33.11 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  32.74 
 
 
449 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  32.44 
 
 
446 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  30.89 
 
 
446 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  28.51 
 
 
445 aa  186  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  30.75 
 
 
444 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  30.53 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  29.69 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  29.02 
 
 
443 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  28.54 
 
 
444 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  26.44 
 
 
442 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  27.78 
 
 
443 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  28.29 
 
 
445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  26.22 
 
 
444 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  27.94 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.92 
 
 
443 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  27.97 
 
 
444 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.76 
 
 
446 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  28.6 
 
 
445 aa  156  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  26.95 
 
 
448 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  26.95 
 
 
448 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  28.82 
 
 
444 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.95 
 
 
445 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.49 
 
 
445 aa  150  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  26.4 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.95 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  28.8 
 
 
444 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  29.45 
 
 
450 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.5 
 
 
464 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.33 
 
 
441 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  24.78 
 
 
441 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  26.17 
 
 
443 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  26.17 
 
 
443 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  27.14 
 
 
463 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  27.17 
 
 
443 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  27.17 
 
 
443 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  26.32 
 
 
442 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  27.33 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.02 
 
 
443 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.39 
 
 
447 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.02 
 
 
443 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.83 
 
 
449 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.83 
 
 
449 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.83 
 
 
449 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  24.61 
 
 
440 aa  136  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  27.14 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  27.37 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  25.86 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  24.94 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.32 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  27.31 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  27.31 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  27.31 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  27.31 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  27.31 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  27.31 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.66 
 
 
445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  27.73 
 
 
447 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  27.73 
 
 
447 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  27.73 
 
 
447 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.74 
 
 
458 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  27.09 
 
 
467 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  25.83 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  28.26 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  27.03 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  27.27 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  25.83 
 
 
445 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.83 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  26.87 
 
 
448 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  25.22 
 
 
443 aa  126  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>