154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0231 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  84.88 
 
 
443 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  98.65 
 
 
443 aa  907    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  917    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  99.55 
 
 
443 aa  913    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  84.88 
 
 
443 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  53.6 
 
 
448 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  53.6 
 
 
448 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  45.64 
 
 
444 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  46.17 
 
 
445 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  46.4 
 
 
445 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  45.05 
 
 
445 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  44.59 
 
 
445 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  42.76 
 
 
444 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  41.35 
 
 
444 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  41.57 
 
 
445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  39.37 
 
 
444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  41.7 
 
 
445 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  37.56 
 
 
444 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  37.33 
 
 
444 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  41.26 
 
 
445 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  41.03 
 
 
445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  39.05 
 
 
443 aa  317  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  38.1 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  37.64 
 
 
441 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  39.37 
 
 
444 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  37.98 
 
 
445 aa  309  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  37.1 
 
 
444 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  36.43 
 
 
443 aa  299  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  36.7 
 
 
472 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  38.08 
 
 
445 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  35.81 
 
 
467 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  35.81 
 
 
467 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  35.81 
 
 
467 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  35.81 
 
 
467 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  35.81 
 
 
467 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  35.81 
 
 
467 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  35.82 
 
 
454 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  37.58 
 
 
455 aa  292  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  35.57 
 
 
468 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  35.84 
 
 
442 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.75 
 
 
458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  36.1 
 
 
443 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  35.87 
 
 
449 aa  285  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  35.87 
 
 
449 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  35.87 
 
 
449 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  34.46 
 
 
445 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  35.73 
 
 
443 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  35.36 
 
 
443 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  36.4 
 
 
443 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  36.18 
 
 
443 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  35.28 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  35.21 
 
 
443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.12 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  35.75 
 
 
448 aa  266  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  34.76 
 
 
440 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  34.9 
 
 
446 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  34.83 
 
 
449 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  34.3 
 
 
448 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  34.16 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  34.16 
 
 
449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  34.16 
 
 
452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  34.6 
 
 
449 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  33.93 
 
 
480 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.78 
 
 
447 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  35.78 
 
 
432 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  35.7 
 
 
448 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  35.7 
 
 
448 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  33.11 
 
 
447 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  33.11 
 
 
447 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  33.11 
 
 
447 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  35.48 
 
 
448 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  35.7 
 
 
448 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  35.7 
 
 
448 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  35.7 
 
 
448 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  35.7 
 
 
448 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  32.88 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  34.74 
 
 
447 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  34.82 
 
 
448 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  31.81 
 
 
429 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  32.14 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.89 
 
 
446 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  41.64 
 
 
301 aa  212  9e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.41 
 
 
445 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  32.93 
 
 
416 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  31.63 
 
 
451 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  31.63 
 
 
451 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  28.25 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  27.23 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  31.69 
 
 
453 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0803  hypothetical protein  31.69 
 
 
453 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0715  hypothetical protein  31.69 
 
 
453 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147759  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1887  hypothetical protein  31.69 
 
 
453 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  29.26 
 
 
450 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  29.26 
 
 
450 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  29.26 
 
 
450 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  29.26 
 
 
450 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  26.39 
 
 
447 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  26.16 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  26.58 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  27.42 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>