153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000430 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  100 
 
 
441 aa  917    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  96.83 
 
 
441 aa  895    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  41.53 
 
 
444 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  40.18 
 
 
444 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  41 
 
 
444 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  37.56 
 
 
444 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  36.79 
 
 
443 aa  343  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  38.88 
 
 
445 aa  341  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  37.99 
 
 
444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  38.96 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  37.58 
 
 
444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  37.36 
 
 
444 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  38.2 
 
 
445 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  36.92 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  36.04 
 
 
445 aa  325  9e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  36.56 
 
 
467 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  36.75 
 
 
454 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  36.82 
 
 
472 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  36.56 
 
 
467 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  36.56 
 
 
467 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  36.56 
 
 
467 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  36.56 
 
 
467 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  36.56 
 
 
467 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  38.34 
 
 
448 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  38.34 
 
 
448 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  36.4 
 
 
445 aa  316  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  34.61 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  37.41 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  37.64 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  37.64 
 
 
443 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  38.43 
 
 
445 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  38.2 
 
 
445 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  36.34 
 
 
444 aa  309  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  35.83 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  36.18 
 
 
445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  38.22 
 
 
445 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  37.28 
 
 
445 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  38 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  34.54 
 
 
443 aa  303  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  34 
 
 
458 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  36.02 
 
 
443 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  34.84 
 
 
455 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  35.12 
 
 
443 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  36.73 
 
 
443 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  34.46 
 
 
443 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  36.73 
 
 
443 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  35.57 
 
 
443 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  37.08 
 
 
445 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.79 
 
 
447 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  33.94 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  32.44 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  33.56 
 
 
449 aa  269  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  33.56 
 
 
449 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  33.56 
 
 
449 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  34.79 
 
 
429 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.56 
 
 
447 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  34.23 
 
 
447 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  33.33 
 
 
480 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  33.33 
 
 
452 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  33.33 
 
 
449 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  33.33 
 
 
480 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  33.56 
 
 
448 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  33.11 
 
 
449 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  32.21 
 
 
449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  32.74 
 
 
447 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  32.74 
 
 
447 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  34.32 
 
 
448 aa  253  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  32.74 
 
 
447 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  32.74 
 
 
447 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.41 
 
 
446 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  30.66 
 
 
440 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  32.44 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  32.21 
 
 
448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  32.21 
 
 
448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  32.21 
 
 
448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  32.21 
 
 
448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  32.21 
 
 
448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  32.21 
 
 
448 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  31.99 
 
 
448 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  31.96 
 
 
432 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  33.01 
 
 
416 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.8 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.31 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  40.45 
 
 
301 aa  189  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  29.57 
 
 
451 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  29.57 
 
 
451 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1178  type VI secretion protein  24.28 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  27.8 
 
 
453 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1887  hypothetical protein  27.8 
 
 
453 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0803  hypothetical protein  27.8 
 
 
453 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0715  hypothetical protein  27.8 
 
 
453 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147759  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0023  hypothetical protein  45.81 
 
 
159 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  25.81 
 
 
444 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  24.55 
 
 
438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  24.33 
 
 
448 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  25.5 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3485  hypothetical protein  25.81 
 
 
442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.778826  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3129  hypothetical protein  25.64 
 
 
442 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000877531  normal  0.24855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  23.66 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  23.66 
 
 
447 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>