151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2809 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  917    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  30.94 
 
 
450 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  26.92 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  26.92 
 
 
448 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.85 
 
 
448 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  26.7 
 
 
448 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  26.23 
 
 
448 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  26.92 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  26.47 
 
 
448 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  26.47 
 
 
448 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  26.47 
 
 
448 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  26.62 
 
 
448 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  26.4 
 
 
468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  27.21 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  26.17 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  26.17 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  25.58 
 
 
433 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  25.62 
 
 
447 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  25.84 
 
 
447 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  25.62 
 
 
447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  25.17 
 
 
447 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  27.46 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  26.09 
 
 
448 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  26.39 
 
 
447 aa  146  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.13 
 
 
446 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  26.86 
 
 
443 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  25.12 
 
 
444 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.22 
 
 
445 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  25.58 
 
 
444 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.65 
 
 
443 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.43 
 
 
443 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  26.52 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  26.29 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  26.29 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  25.49 
 
 
450 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  25.27 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  25.27 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  25.05 
 
 
450 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  25.27 
 
 
450 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.37 
 
 
443 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  24.65 
 
 
444 aa  126  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  24.65 
 
 
444 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  25.88 
 
 
445 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  27.57 
 
 
451 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  26.01 
 
 
443 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  25.83 
 
 
443 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  25.58 
 
 
449 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  26.33 
 
 
441 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  25.68 
 
 
480 aa  123  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  25.72 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.87 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  24.89 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  25.82 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  25.82 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  25.55 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  24.39 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  25.82 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.33 
 
 
464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.71 
 
 
446 aa  120  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.58 
 
 
447 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  25.23 
 
 
480 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  24.09 
 
 
445 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  27.75 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  25.23 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  25.23 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  26.4 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  25.39 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  25.74 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  25.05 
 
 
449 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  25.49 
 
 
448 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  25.39 
 
 
447 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  25.39 
 
 
447 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  25.39 
 
 
447 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  25.22 
 
 
449 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  25.62 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  25.87 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  23.4 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  25.22 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.23 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  25.62 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  24.22 
 
 
463 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  24.94 
 
 
441 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  24.53 
 
 
444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  23.36 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  23.7 
 
 
445 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  25.11 
 
 
448 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  26.29 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  24.28 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  25.28 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  24.03 
 
 
443 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  24.03 
 
 
443 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  22.68 
 
 
445 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  23.52 
 
 
468 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  24.13 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0857  hypothetical protein  24.72 
 
 
464 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  23.57 
 
 
443 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  25.39 
 
 
448 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  25.56 
 
 
448 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  25.39 
 
 
448 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  24.94 
 
 
444 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>