142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3047 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  100 
 
 		 464 aa  941    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  92.89 
 
 		 464 aa  876    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  51.08 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  47.93 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0857  hypothetical protein  34.13 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2136  hypothetical protein  35.43 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.293887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0617  hypothetical protein  35 
 
 		 477 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.327772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0728  hypothetical protein  35 
 
 		 477 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.533784  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0732  hypothetical protein  35 
 
 		 465 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2038  hypothetical protein  35 
 
 		 477 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1686  hypothetical protein  35 
 
 		 465 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0545  hypothetical protein  34.78 
 
 		 866 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  27.48 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  26.51 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  26.51 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  25.92 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  26.42 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  26.42 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  26.42 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  26.08 
 
 		 448 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0015  hypothetical protein  23.97 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.947734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  26.58 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  26.58 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  26.37 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.86 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  26.37 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  26.08 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  26.42 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  25.32 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  26.42 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  26.42 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  23.44 
 
 		 448 aa  123  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  27.54 
 
 		 444 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  29.27 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  24.36 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  24.94 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  27.94 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  27.94 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  27.94 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  24.15 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  26.15 
 
 		 444 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.92 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  23.28 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.92 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.92 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  26.35 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  27.49 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  27.43 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  26.75 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  25.38 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  25.22 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  26.8 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  26.26 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.44 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  26.33 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  23.77 
 
 		 443 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.17 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  25.27 
 
 		 448 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  25.27 
 
 		 448 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  24.68 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  26.75 
 
 		 443 aa  98.2  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  24.53 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  25.17 
 
 		 445 aa  97.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  23.55 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  24.15 
 
 		 448 aa  96.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  26.23 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  26.23 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  26.96 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  26.23 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  26.23 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  26.23 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  26.23 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  26.23 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  26.49 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  26.65 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  23.34 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  24.07 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.45 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  22.89 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  24.67 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  22.94 
 
 		 443 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  22.94 
 
 		 443 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  26.48 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  25.11 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.5 
 
 		 447 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  26.26 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  26.05 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  25.11 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  26.05 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  25.11 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  25.11 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  25.11 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  26.05 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  25.11 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  25.11 
 
 		 448 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.81 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  23.18 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  26.05 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  23.18 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  26.08 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>