135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0015 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0015  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  920    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.947734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  26.57 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  25.91 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0857  hypothetical protein  24.62 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2136  hypothetical protein  23.54 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.293887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2038  hypothetical protein  23.54 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  23.97 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0732  hypothetical protein  23.54 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0617  hypothetical protein  23.54 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.327772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0728  hypothetical protein  23.54 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.533784  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1686  hypothetical protein  23.54 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0545  hypothetical protein  23.57 
 
 		 866 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.14 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  21.96 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  22.93 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  22.72 
 
 		 448 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  22.72 
 
 		 448 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  22.72 
 
 		 448 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  22.51 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  22.51 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  22.51 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  21.91 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  23.26 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  21.91 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  21.91 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  22.22 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  21.11 
 
 		 448 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  21.09 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  22.2 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  22.2 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  20.27 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  19.57 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  20.35 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  21.24 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  20.49 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  20.61 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  22.92 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  22.92 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  22.92 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  21.1 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  21.1 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  23.25 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  21.1 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  22.4 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  21.28 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  20.04 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  20.43 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  23.45 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  23.45 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  20.52 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  19.44 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  20.86 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  19.44 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  22.05 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  19.87 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  21.92 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  19.44 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  20.57 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  20.6 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  21.84 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  31.49 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  33.12 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  20.46 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  20.9 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  20.9 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  20.9 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  21.4 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  20.9 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  20.9 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  20.9 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  20.9 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  20.81 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  20.04 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  32.41 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  22.2 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  23.37 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  22.57 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  20.19 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  32.5 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  20.09 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  19.27 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  18.76 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  19.36 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  30.95 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  20.13 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  32 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  20.37 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  22.4 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  31.48 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  31.78 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  21.56 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  34.52 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  17.51 
 
 		 458 aa  54.3  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  25.75 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  21.18 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  20.47 
 
 		 480 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  20.47 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  20.47 
 
 		 452 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  20.47 
 
 		 449 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50780  hypothetical protein  22.27 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>