155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4960 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  86.58 
 
 		 447 aa  825    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  915    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  87.25 
 
 		 447 aa  828    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  86.35 
 
 		 447 aa  823    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  87.25 
 
 		 447 aa  829    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  64.51 
 
 		 448 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  41.26 
 
 		 448 aa  349  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  41.16 
 
 		 448 aa  342  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  42.67 
 
 		 448 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  41.61 
 
 		 448 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  41.61 
 
 		 448 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  41.83 
 
 		 448 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  41.78 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  41.16 
 
 		 448 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  41.16 
 
 		 448 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  41.16 
 
 		 448 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  41.61 
 
 		 448 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  41.61 
 
 		 449 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  42.23 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  41.83 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  41.83 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  41.83 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  37.3 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  47.25 
 
 		 276 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  34.67 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  34.89 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  36 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  34.44 
 
 		 450 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  34.97 
 
 		 445 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  34.44 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  34.44 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  32.59 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  35.27 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  32.15 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  28.16 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  30.44 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  30 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  28.32 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  30.22 
 
 		 444 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  26.61 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  29.23 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  27.21 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  29.14 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  27.63 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  26.75 
 
 		 445 aa  163  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  26.95 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  29.54 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.91 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  28.7 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  26.77 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  26.77 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.91 
 
 		 445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.38 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.69 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  28.29 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  28.25 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  26.55 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  27.34 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.48 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  29.2 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  26.48 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  26.67 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  26.67 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  28.54 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  27.65 
 
 		 445 aa  147  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.12 
 
 		 458 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.13 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  28.2 
 
 		 472 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  26.67 
 
 		 443 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.4 
 
 		 443 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  26.21 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  26.21 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.29 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  26.85 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.4 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  27.35 
 
 		 450 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.56 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  27.51 
 
 		 454 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  25.85 
 
 		 463 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  27.51 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.61 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.61 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.61 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  27.29 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  23.44 
 
 		 441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  23.21 
 
 		 441 aa  136  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  27.51 
 
 		 468 aa  136  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  25.99 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  26.93 
 
 		 448 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  26.61 
 
 		 447 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  26.61 
 
 		 447 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  26.61 
 
 		 447 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  28.29 
 
 		 448 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  26.61 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.5 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  24.39 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>