143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0429 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  930    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  82.9 
 
 		 463 aa  785    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  48.92 
 
 		 464 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  47.93 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0857  hypothetical protein  42.36 
 
 		 464 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2038  hypothetical protein  43.67 
 
 		 477 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2136  hypothetical protein  43.67 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.293887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0617  hypothetical protein  43.45 
 
 		 477 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.327772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0728  hypothetical protein  43.45 
 
 		 477 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.533784  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0732  hypothetical protein  43.45 
 
 		 465 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1686  hypothetical protein  43.45 
 
 		 465 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0545  hypothetical protein  43.45 
 
 		 866 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0015  hypothetical protein  25.91 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.947734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  27.37 
 
 		 448 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  26.67 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  26.67 
 
 		 448 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  27.93 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  27.93 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  27.93 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  25.85 
 
 		 447 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  26.02 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  26.32 
 
 		 447 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  26.61 
 
 		 447 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  27.14 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  26.53 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  26.32 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  24.52 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  24.52 
 
 		 448 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.35 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  25.8 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  28.69 
 
 		 448 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  27.39 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  25.63 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  28.38 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  26.86 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  26.86 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  25.42 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  25 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  25.42 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  24.57 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  26.16 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  25.66 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  26.67 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  25.72 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  24.57 
 
 		 443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  25.99 
 
 		 449 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  25.99 
 
 		 449 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  25.99 
 
 		 449 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  24.57 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  25.47 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.33 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.9 
 
 		 441 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  28.51 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  26.93 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  26.93 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  27.84 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  26.93 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  26.93 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  23.61 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  25.11 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  26.71 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  26.71 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  26.71 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.48 
 
 		 447 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.9 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  27.11 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  28.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  28.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  28.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  28.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  28.21 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  28.63 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  29.14 
 
 		 447 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  26.5 
 
 		 480 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  26.23 
 
 		 444 aa  106  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  25.76 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  24.18 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  27.11 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  28.63 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  27.04 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  27.93 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  25.16 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  25.16 
 
 		 454 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  25.16 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  25.16 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  25.16 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  25.16 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  22.93 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  24.95 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.62 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  23.7 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  21.75 
 
 		 445 aa  101  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  27.23 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  24.9 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  24.03 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.99 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  25 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  22.7 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  23.59 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.85 
 
 		 445 aa  97.8  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>