151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5264 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  897    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  90.58 
 
 
276 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  53.57 
 
 
449 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  48.22 
 
 
450 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  47.78 
 
 
450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  47.56 
 
 
450 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  47.11 
 
 
450 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  46.22 
 
 
450 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  44.74 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  45.07 
 
 
445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  44.99 
 
 
451 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  41.26 
 
 
447 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  41.26 
 
 
447 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  41.26 
 
 
447 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  41.48 
 
 
447 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  41.03 
 
 
447 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  42.19 
 
 
449 aa  335  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  40.78 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  38.03 
 
 
448 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  38.18 
 
 
448 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  38.06 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  38.06 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  38.06 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  37.61 
 
 
448 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  37.61 
 
 
448 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  37.61 
 
 
448 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  37.1 
 
 
448 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  36.94 
 
 
448 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  37.1 
 
 
468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  36.2 
 
 
448 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  37.1 
 
 
448 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  37.1 
 
 
448 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  35.51 
 
 
447 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  30.13 
 
 
444 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  31.7 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  30 
 
 
443 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  28.03 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  30.51 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  28.25 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  28.25 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  27.52 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  30.07 
 
 
445 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  31.57 
 
 
443 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  26.85 
 
 
444 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.84 
 
 
445 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  28.44 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  28.44 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  29.36 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  27.35 
 
 
443 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  27.35 
 
 
443 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  29.53 
 
 
445 aa  161  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  29.78 
 
 
444 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  29.11 
 
 
444 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  29.31 
 
 
445 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  24.43 
 
 
442 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  28.99 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  31.46 
 
 
445 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  27.8 
 
 
444 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  27.81 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  28.27 
 
 
454 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  28.27 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  28.27 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  28.27 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  28.27 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  28.27 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  28.05 
 
 
467 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  28.44 
 
 
455 aa  146  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  26 
 
 
445 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  29.15 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  25.5 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  27.78 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.87 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  29.37 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.87 
 
 
443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.25 
 
 
446 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  27.03 
 
 
444 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  25.17 
 
 
443 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  25.33 
 
 
443 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  28.92 
 
 
445 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.19 
 
 
443 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  27.68 
 
 
472 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  28.88 
 
 
450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  25.06 
 
 
441 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.34 
 
 
447 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  26.09 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  23.71 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.55 
 
 
449 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.55 
 
 
449 aa  130  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.55 
 
 
449 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  27.97 
 
 
445 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.71 
 
 
464 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  29.32 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.57 
 
 
446 aa  126  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.66 
 
 
429 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  27.77 
 
 
463 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  27.09 
 
 
448 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.44 
 
 
458 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  27.39 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.71 
 
 
447 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.27 
 
 
464 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>