152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0378 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  71.65 
 
 		 448 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  90.62 
 
 		 448 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  96.43 
 
 		 448 aa  887    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  98.66 
 
 		 448 aa  903    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  98.88 
 
 		 448 aa  903    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  90.18 
 
 		 448 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  98.88 
 
 		 448 aa  903    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  912    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  98.88 
 
 		 448 aa  903    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  90.85 
 
 		 468 aa  821    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  88.84 
 
 		 448 aa  829    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  90.62 
 
 		 448 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  99.78 
 
 		 448 aa  909    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  57.14 
 
 		 433 aa  511  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  56.76 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  41.61 
 
 		 447 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  40.72 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  40.72 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  40.49 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  40.72 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  38.75 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  37.61 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  35.59 
 
 		 449 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  41.91 
 
 		 276 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  32.28 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  32.05 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  32.05 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  32.05 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  32.51 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  30.51 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  32.88 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  30.22 
 
 		 443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  33.18 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  31.83 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  31.83 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  32.88 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.7 
 
 		 443 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  27.31 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  29.78 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  26.83 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  29.19 
 
 		 446 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  28.54 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  29.02 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  29.58 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  26.92 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.27 
 
 		 446 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  30.09 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  29.91 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  29.91 
 
 		 467 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  29.91 
 
 		 467 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  29.91 
 
 		 467 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  29.91 
 
 		 467 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  29.91 
 
 		 467 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.56 
 
 		 445 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.17 
 
 		 445 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  29.69 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.17 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.57 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.42 
 
 		 447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  28.6 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  29.09 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.17 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  163  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  28.76 
 
 		 449 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  29.37 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  27.72 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  25.94 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  25.9 
 
 		 443 aa  160  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  25.9 
 
 		 443 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  28.32 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.64 
 
 		 458 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  26.49 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  29.13 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  26.49 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  28.41 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  28.7 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  28.16 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  27.91 
 
 		 443 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3047  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.51 
 
 		 464 aa  149  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  27.54 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1203  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.57 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  26.77 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  26.32 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  27.91 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.59 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.83 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.59 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.59 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  27.17 
 
 		 450 aa  144  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  26.35 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  26.99 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  26.67 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  27.43 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  27.21 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  27.21 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  27.72 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  27.21 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  27.21 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>