147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0800 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  100 
 
 		 450 aa  914    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  98.89 
 
 		 450 aa  904    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  94.67 
 
 		 450 aa  876    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  99.78 
 
 		 450 aa  912    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  99.11 
 
 		 450 aa  910    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  66.67 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  58.89 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  55.19 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  51 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  47.78 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  39.33 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  50.54 
 
 		 276 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  33.78 
 
 		 447 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  33.11 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  34.44 
 
 		 447 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  33.11 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  33.86 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  34.56 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  33.26 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  32.29 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  32.05 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  32.05 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  32.05 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.21 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  32.05 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  32.05 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  31.83 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  32.43 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  32.43 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  32.21 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  31.38 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  31.03 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  29.26 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  29.26 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  29.26 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  28.89 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  26.93 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  27.85 
 
 		 448 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  27.85 
 
 		 448 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  29.24 
 
 		 443 aa  156  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  27.29 
 
 		 444 aa  156  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  27.74 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  27.72 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  27.46 
 
 		 444 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  29.45 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  28.38 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  29.45 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  28.6 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  28.79 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.38 
 
 		 445 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.95 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.29 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  28.31 
 
 		 445 aa  143  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.15 
 
 		 445 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.95 
 
 		 445 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  25.95 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  27.03 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  28.54 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  27.75 
 
 		 443 aa  136  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  27.13 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.93 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.93 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  28.41 
 
 		 445 aa  133  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  28.51 
 
 		 445 aa  134  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  25.93 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.92 
 
 		 447 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  25.93 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  28.54 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  28.54 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  28.54 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  28.54 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  28.54 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  28.54 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  27.84 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  26.91 
 
 		 472 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  28.33 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.34 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.99 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  29.37 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  29.15 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  27.29 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  25.54 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.71 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  28.22 
 
 		 455 aa  120  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  28.12 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  25.32 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  25.27 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.78 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.78 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.78 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  23.74 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.38 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1178  type VI secretion protein  20.65 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  25.71 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  24.94 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.33 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  27.37 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  27.15 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  27.37 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>