134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1178 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1178  type VI secretion protein  100 
 
 
452 aa  915    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  25.45 
 
 
444 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  27.58 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  25.22 
 
 
448 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  25.22 
 
 
448 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  24.5 
 
 
441 aa  171  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  25.11 
 
 
444 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.28 
 
 
441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  24.89 
 
 
443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  24.89 
 
 
443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.94 
 
 
445 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  24.72 
 
 
445 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  22.65 
 
 
444 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  22.65 
 
 
444 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  22.54 
 
 
444 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.28 
 
 
445 aa  159  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  23.33 
 
 
443 aa  159  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  23.33 
 
 
443 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  22.3 
 
 
445 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  21.92 
 
 
444 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  23.33 
 
 
443 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  20.27 
 
 
443 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.06 
 
 
445 aa  156  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  22.39 
 
 
443 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  24.51 
 
 
445 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  22.25 
 
 
445 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  23.71 
 
 
446 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  23.45 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  23.35 
 
 
442 aa  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  23.43 
 
 
455 aa  140  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  22.82 
 
 
445 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  22.05 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  23.85 
 
 
445 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  23.63 
 
 
445 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  21.33 
 
 
443 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  21.83 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  21.83 
 
 
454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  21.71 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  22.42 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  21.83 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  21.83 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  21.83 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  21.83 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  21.83 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  21.62 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  20.94 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  22.62 
 
 
449 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  22.62 
 
 
449 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  22.62 
 
 
449 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  24.61 
 
 
448 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  23.5 
 
 
445 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  20.09 
 
 
447 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  19.87 
 
 
448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  21.52 
 
 
446 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  22.6 
 
 
447 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  22.6 
 
 
447 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  22.6 
 
 
447 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  21.05 
 
 
447 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  21.43 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  21.43 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  21.43 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  21.43 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  21.43 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  21.43 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  21.43 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  22.6 
 
 
447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  19.82 
 
 
447 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  20.48 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  21.11 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  20.58 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  20.13 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  21.88 
 
 
449 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  20.53 
 
 
429 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  20.26 
 
 
447 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  21.43 
 
 
480 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  19.91 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  20.88 
 
 
447 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  19.91 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  20.96 
 
 
433 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  20.13 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  19.56 
 
 
448 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  21.06 
 
 
450 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  20.65 
 
 
450 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  20.35 
 
 
447 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  21.21 
 
 
480 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  20.65 
 
 
450 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  21.21 
 
 
449 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  21.21 
 
 
452 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  20.65 
 
 
450 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  19.69 
 
 
448 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  19.69 
 
 
448 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  19.69 
 
 
448 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  19.69 
 
 
448 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  21.06 
 
 
450 aa  106  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  19.26 
 
 
448 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  20.09 
 
 
443 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  23.14 
 
 
451 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  23.14 
 
 
451 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  19.04 
 
 
448 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  19.68 
 
 
416 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>