153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4080 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  90.56 
 
 		 445 aa  792    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  910    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  90.11 
 
 		 445 aa  817    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  90.56 
 
 		 445 aa  793    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  50.56 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  47.97 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  50.68 
 
 		 445 aa  455  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  47.63 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  50.56 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  50.34 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  49.44 
 
 		 445 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  45.98 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  45.98 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  45.17 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  44.94 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  44.27 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  41.22 
 
 		 443 aa  353  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  41.48 
 
 		 443 aa  352  8e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  41.48 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  39.86 
 
 		 443 aa  349  7e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  41.44 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  41.44 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  37.3 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  37.75 
 
 		 441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  38.74 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  38.51 
 
 		 444 aa  319  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  37.75 
 
 		 445 aa  315  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  38.74 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  37.89 
 
 		 467 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  37.89 
 
 		 467 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  37.89 
 
 		 467 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  37.89 
 
 		 467 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  37.89 
 
 		 467 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  37.89 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  37.89 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  38.83 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  39.14 
 
 		 455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  37.8 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  36.91 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.68 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  37.67 
 
 		 446 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  35.65 
 
 		 445 aa  299  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  38.03 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  37.78 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  35.06 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  35.06 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  31.67 
 
 		 442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  37.64 
 
 		 445 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  34.16 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  34.16 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  38.5 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.94 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  37.19 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  37.19 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  37.19 
 
 		 448 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  37.19 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  37.19 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  37.19 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  37.19 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  36.61 
 
 		 447 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  45.19 
 
 		 301 aa  259  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  33.63 
 
 		 448 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  32.95 
 
 		 440 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  34.6 
 
 		 480 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  34.6 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  34.6 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.11 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  35.8 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  34.38 
 
 		 480 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  34.3 
 
 		 448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  33.93 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  32.81 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  32.81 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  32.81 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  34.38 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.26 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  35.33 
 
 		 447 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  32.21 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  32.21 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  32.21 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  32.21 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  34.22 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  30.77 
 
 		 445 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  29.03 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0023  hypothetical protein  51.9 
 
 		 159 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  27.98 
 
 		 444 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  28.95 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  28.95 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1887  hypothetical protein  32.37 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  29.02 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  32 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0803  hypothetical protein  32 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0715  hypothetical protein  32 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  31.13 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3485  hypothetical protein  30.25 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.778826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  26.67 
 
 		 448 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  26.44 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  26.44 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  26.44 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  26.22 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>