145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0622 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0622  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  553  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0579969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  90.58 
 
 		 448 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  57.66 
 
 		 449 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  47.25 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  46.52 
 
 		 447 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  45.79 
 
 		 447 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  46.15 
 
 		 447 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  45.42 
 
 		 447 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  50.54 
 
 		 450 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  50.54 
 
 		 450 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  50.54 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  50.54 
 
 		 450 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  50.18 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  43.8 
 
 		 448 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3259  type VI secretion protein  46.01 
 
 		 451 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  43.38 
 
 		 433 aa  230  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1785  hypothetical protein  46.49 
 
 		 446 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.414468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  42.65 
 
 		 448 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  45.26 
 
 		 449 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  42.28 
 
 		 448 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  42.28 
 
 		 448 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  42.28 
 
 		 448 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3125  hypothetical protein  44.16 
 
 		 445 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  41.91 
 
 		 448 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  41.91 
 
 		 448 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  41.91 
 
 		 448 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  41.18 
 
 		 448 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  41.18 
 
 		 448 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  41.24 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  40.44 
 
 		 448 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  41.18 
 
 		 468 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  41.18 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  41.18 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  30.04 
 
 		 444 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  31.72 
 
 		 443 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  28.21 
 
 		 443 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  28.57 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  28.57 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  28.57 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  29.67 
 
 		 445 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  31.84 
 
 		 446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  28.21 
 
 		 448 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  28.21 
 
 		 448 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  30.04 
 
 		 445 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  30.4 
 
 		 445 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  30.83 
 
 		 443 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  27.84 
 
 		 444 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  30.04 
 
 		 445 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  30.4 
 
 		 445 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  27.14 
 
 		 444 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  29.43 
 
 		 444 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  23.53 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  25.64 
 
 		 444 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  29.3 
 
 		 445 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  29.3 
 
 		 445 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  28.21 
 
 		 445 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  28.73 
 
 		 445 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  25.37 
 
 		 445 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  27.44 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  27.44 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  27.44 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  27.44 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  27.44 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  27.44 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.1 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  27.08 
 
 		 467 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  26.97 
 
 		 444 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.1 
 
 		 443 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  26.97 
 
 		 444 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  27.44 
 
 		 468 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  26.28 
 
 		 445 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.68 
 
 		 447 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  27.94 
 
 		 450 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.7 
 
 		 445 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  27.9 
 
 		 472 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.55 
 
 		 458 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  25.74 
 
 		 440 aa  96.3  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  25.83 
 
 		 441 aa  95.5  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  26.47 
 
 		 443 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.32 
 
 		 446 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  25 
 
 		 443 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  27.08 
 
 		 455 aa  92.8  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  24.63 
 
 		 443 aa  92  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  27.17 
 
 		 463 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  28.57 
 
 		 449 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  25.09 
 
 		 441 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  27.04 
 
 		 463 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  27.45 
 
 		 442 aa  89.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  24.91 
 
 		 444 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  27.11 
 
 		 416 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  25.65 
 
 		 448 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  26.1 
 
 		 448 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  32.8 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.54 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.37 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.44 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0857  hypothetical protein  28 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>