More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2683 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2683  inner-membrane translocator  100 
 
 
363 aa  654    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0005173  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  39.42 
 
 
373 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.12 
 
 
365 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  38.86 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.84 
 
 
355 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  36.02 
 
 
369 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  34.04 
 
 
369 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  34.38 
 
 
364 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  34.3 
 
 
364 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  35.93 
 
 
369 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
369 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  33.02 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
368 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.84 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  31.01 
 
 
367 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  32.33 
 
 
361 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
360 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.76 
 
 
352 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
360 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  34.34 
 
 
338 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  31.27 
 
 
365 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  32.29 
 
 
355 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  33.02 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  34.55 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.37 
 
 
367 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
347 aa  146  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
350 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  29.23 
 
 
391 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
357 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  33.93 
 
 
354 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
350 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  28.94 
 
 
360 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  35.17 
 
 
347 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  31.44 
 
 
364 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  38.14 
 
 
451 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
361 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.09 
 
 
344 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  30.98 
 
 
352 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  35.63 
 
 
387 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  35.46 
 
 
349 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
371 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  31.61 
 
 
357 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  31.23 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.82 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  35.56 
 
 
383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  30.7 
 
 
357 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
352 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  34.91 
 
 
358 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  34.28 
 
 
360 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  34.47 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
362 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  32.62 
 
 
365 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
359 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  36.74 
 
 
360 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  32.27 
 
 
368 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.71 
 
 
349 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
377 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  37.04 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
360 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
363 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  36.78 
 
 
368 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 
358 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  35.41 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 
360 aa  136  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 
347 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.23 
 
 
352 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
349 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  29.14 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  34.97 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  35.13 
 
 
347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  32.5 
 
 
366 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  35.51 
 
 
357 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  34.86 
 
 
361 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.04 
 
 
365 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  29.87 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  32.19 
 
 
366 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  30.37 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  36 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.96 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  36.47 
 
 
366 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  31.6 
 
 
340 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  30.35 
 
 
361 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.21 
 
 
362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  34.5 
 
 
437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.79 
 
 
427 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  34.73 
 
 
365 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  32.13 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  31.93 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  30.72 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  33.62 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  30.72 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  33.23 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0986028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>