More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0156 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0156  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  927    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1346  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.85 
 
 		 508 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  29.37 
 
 		 513 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3543  2-alkenal reductase  30.8 
 
 		 577 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  27.12 
 
 		 452 aa  103  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  27.3 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5254  2-alkenal reductase  27.56 
 
 		 395 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  29.77 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5610  serine protease  27.56 
 
 		 381 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5158  serine protease  27.56 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4001  2-alkenal reductase  28.26 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5645  serine protease  27.56 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0281098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5567  serine protease  27.56 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7078e-38 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  28.63 
 
 		 485 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5351  serine protease  27.24 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000264065  hitchhiker  6.04762e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5142  serine protease  27.56 
 
 		 391 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  28.29 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.34 
 
 		 384 aa  94.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  29.2 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5584  serine protease  27.24 
 
 		 391 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 398 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  30.5 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  30.3 
 
 		 488 aa  93.6  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  28.47 
 
 		 465 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  30.42 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  28.1 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  29.7 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  29.7 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  30.07 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  28.91 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  27.43 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5314  serine protease  27.24 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  27.14 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5710  serine protease  27.24 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.2 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.2 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  29.2 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  29.97 
 
 		 505 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  27.74 
 
 		 407 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  27.14 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  27.74 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  29.71 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.63 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.26 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  26.43 
 
 		 525 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  28.83 
 
 		 401 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.83 
 
 		 401 aa  90.5  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.83 
 
 		 401 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  28.1 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  28.1 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  28.1 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  28.1 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  28.1 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  29.63 
 
 		 382 aa  90.1  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  28.08 
 
 		 467 aa  90.1  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  30 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  28.1 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.82 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  26.14 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  27.27 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  28.44 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  30.07 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  28.73 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  28.1 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  28.44 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  27.12 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  27.27 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  27.78 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  23.29 
 
 		 535 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  27.12 
 
 		 404 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  29.64 
 
 		 451 aa  87.4  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  27.34 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  27.74 
 
 		 388 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  30.3 
 
 		 493 aa  87  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  26.74 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  29.17 
 
 		 487 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.02 
 
 		 428 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  29.33 
 
 		 453 aa  86.7  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  29.29 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  28.08 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3121  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.43 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  29.96 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  28.62 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  27.5 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  31.62 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  29.88 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  31.62 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  31.62 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  29.96 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  27.46 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  31.62 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  28 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  26.49 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  27.46 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  28 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  29.62 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  31.36 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  27.15 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  29.56 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>