More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2363 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2363  diguanylate cyclase  100 
 
 		 493 aa  991    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.667022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4471  diguanylate cyclase  63.1 
 
 		 505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896589  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0948  EAL/GGDEF domain-containing protein  42.83 
 
 		 786 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1160  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  42.4 
 
 		 772 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2221  EAL/GGDEF domain-containing protein  42.4 
 
 		 786 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1311  hypothetical protein  42.4 
 
 		 786 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432908  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2074  EAL/GGDEF domain-containing protein  42.4 
 
 		 786 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257022  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0706  EAL/GGDEF domain-containing protein  42.4 
 
 		 786 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2540  EAL/GGDEF domain-containing protein  42.4 
 
 		 786 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1151  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  42.4 
 
 		 772 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3335  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.4 
 
 		 786 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.874837  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1209  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.98 
 
 		 784 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.79 
 
 		 791 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00275819  normal  0.0440432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.04 
 
 		 779 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2354  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.63 
 
 		 790 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2375  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.63 
 
 		 790 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.83 
 
 		 778 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2272  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.83 
 
 		 779 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1742  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.42 
 
 		 790 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5693  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.59 
 
 		 730 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1306  diguanylate cyclase  28.66 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  35.41 
 
 		 729 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  27.35 
 
 		 494 aa  146  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  32.42 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  31.56 
 
 		 516 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  32.04 
 
 		 492 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  30.92 
 
 		 492 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  30.94 
 
 		 522 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  32.7 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  30.24 
 
 		 506 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  30.08 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  29.63 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4321  diguanylate cyclase  30.21 
 
 		 534 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  30.49 
 
 		 516 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  30.46 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  30.21 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  30.48 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  29.28 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  30.22 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  30.14 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  30.46 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  29.78 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  29.02 
 
 		 501 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  31.42 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  29.86 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  29.59 
 
 		 492 aa  123  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  30.16 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  27.79 
 
 		 508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  30.75 
 
 		 505 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  30.75 
 
 		 505 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  30.35 
 
 		 506 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  29.34 
 
 		 524 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  28.4 
 
 		 506 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 529 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.82 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.82 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3694  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.82 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0693  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.82 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  31.08 
 
 		 589 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1348  diguanylate cyclase  26.4 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  27.03 
 
 		 516 aa  118  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  30.37 
 
 		 506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  28.46 
 
 		 522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6264  diguanylate cyclase  27.73 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.291677  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6666  diguanylate cyclase  27.73 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6431  diguanylate cyclase  27.73 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  30.09 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3492  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  29.44 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  29.65 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  29.49 
 
 		 527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  30.09 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  30.09 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.91 
 
 		 765 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  29.44 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  28.43 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  29.44 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  30.89 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2003  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.8 
 
 		 770 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000215856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  27.03 
 
 		 504 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  28.13 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1999  diguanylate cyclase  39.53 
 
 		 612 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3221  sensory box-containing diguanylate cyclase  42.04 
 
 		 858 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  31.51 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3475  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.4 
 
 		 571 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  31.51 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3372  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.77 
 
 		 659 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1609  multisensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  36.55 
 
 		 944 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  28.07 
 
 		 493 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  31.51 
 
 		 521 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.51 
 
 		 1101 aa  113  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0581  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.14 
 
 		 659 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1447  RNase II stability modulator  40 
 
 		 663 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00630627  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00808  hypothetical protein  40.4 
 
 		 578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.41 
 
 		 891 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1237  sensory box protein  42.26 
 
 		 712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.267434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  28.69 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>