More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4471 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4471  diguanylate cyclase  100 
 
 		 505 aa  1009    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896589  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2363  diguanylate cyclase  63.1 
 
 		 493 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.667022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0948  EAL/GGDEF domain-containing protein  43.07 
 
 		 786 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2540  EAL/GGDEF domain-containing protein  42.64 
 
 		 786 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2221  EAL/GGDEF domain-containing protein  42.64 
 
 		 786 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2074  EAL/GGDEF domain-containing protein  42.64 
 
 		 786 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257022  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1311  hypothetical protein  42.64 
 
 		 786 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0706  EAL/GGDEF domain-containing protein  42.64 
 
 		 786 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1160  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  42.64 
 
 		 772 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1151  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  42.64 
 
 		 772 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3335  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.04 
 
 		 786 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.874837  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.22 
 
 		 791 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00275819  normal  0.0440432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1209  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.98 
 
 		 784 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2354  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.35 
 
 		 790 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2375  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.35 
 
 		 790 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.14 
 
 		 779 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2272  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.93 
 
 		 779 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.68 
 
 		 778 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1742  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.14 
 
 		 790 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5693  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.14 
 
 		 730 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1306  diguanylate cyclase  29.79 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  33.84 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  33.88 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  32.75 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  32.24 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  27.29 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  33.07 
 
 		 492 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 492 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  32.69 
 
 		 516 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  34.9 
 
 		 729 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  32.22 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  29.52 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  32.6 
 
 		 529 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  30.8 
 
 		 510 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  28.25 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  29.6 
 
 		 505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  32.03 
 
 		 510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  30.99 
 
 		 506 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0533  diguanylate cyclase  28.91 
 
 		 480 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  29.03 
 
 		 522 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0546  diguanylate cyclase  28.04 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  31.78 
 
 		 503 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  30.9 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  30.9 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  33.16 
 
 		 532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  27.18 
 
 		 501 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  31.61 
 
 		 506 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3328  GGDEF  26.94 
 
 		 548 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3598  diguanylate cyclase  32.29 
 
 		 510 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  31.61 
 
 		 489 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  31.61 
 
 		 489 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  31.61 
 
 		 484 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  31.61 
 
 		 499 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  31.61 
 
 		 499 aa  127  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  31.61 
 
 		 499 aa  127  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0510  hypothetical protein  42.11 
 
 		 701 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0522945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  33.42 
 
 		 510 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  30.83 
 
 		 521 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  30.83 
 
 		 521 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  29.3 
 
 		 504 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  30.56 
 
 		 527 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.66 
 
 		 906 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1165  diguanylate cyclase  27.83 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 		 765 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  32.01 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  28.77 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5422  sensory box/GGDEF family protein  31.85 
 
 		 909 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.500636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  26.32 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  31.75 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  31.75 
 
 		 528 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0616  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.28 
 
 		 674 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  31.75 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  31.75 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  31.75 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.05 
 
 		 1466 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  31.75 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  30.56 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  31.71 
 
 		 507 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3492  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5426  sensory box/GGDEF family protein  30.65 
 
 		 909 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5477  sensory box/GGDEF family protein  30.65 
 
 		 909 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1609  multisensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  38.95 
 
 		 944 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  28.33 
 
 		 503 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 508 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6264  diguanylate cyclase  28.26 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.291677  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.47 
 
 		 693 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57074  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2517  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.82 
 
 		 614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655073  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6666  diguanylate cyclase  28.48 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6431  diguanylate cyclase  28.48 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.25 
 
 		 842 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  28.81 
 
 		 506 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  31.68 
 
 		 474 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.379327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>