113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5849 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 429 aa  752    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  99.27 
 
 		 274 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  77 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  80.15 
 
 		 278 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  67.06 
 
 		 472 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  64.66 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  58.11 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  65.18 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  65.18 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  65.18 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  63.49 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  56.76 
 
 		 423 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  55.37 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  52.36 
 
 		 471 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  50.74 
 
 		 473 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  40.86 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.45 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.76 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  40.07 
 
 		 516 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  40.07 
 
 		 517 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  43.15 
 
 		 527 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.83 
 
 		 491 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.83 
 
 		 491 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  43.81 
 
 		 558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.04 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  36.07 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  36.42 
 
 		 535 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.23 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  41.43 
 
 		 527 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  37.12 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  38.52 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  42.19 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  36.49 
 
 		 587 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.09 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.09 
 
 		 374 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  40.44 
 
 		 436 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  40.44 
 
 		 436 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  40.44 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  36.9 
 
 		 584 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  38.7 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  38.5 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  38.21 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39 
 
 		 361 aa  90.1  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.5 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  39.22 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  40.22 
 
 		 409 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  41.78 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.47 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 601 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.43 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  40.56 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1408 aa  72.8  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.18 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  40 
 
 		 587 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  35.65 
 
 		 903 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  34.51 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  34.23 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  48.75 
 
 		 559 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  33.88 
 
 		 813 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  36.7 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  36.04 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  37.14 
 
 		 582 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  30.2 
 
 		 307 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  31.82 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  38.83 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  34.48 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  35.96 
 
 		 288 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  37.14 
 
 		 835 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  41.18 
 
 		 1580 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  34.45 
 
 		 706 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  34.45 
 
 		 748 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  35.54 
 
 		 936 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  34.62 
 
 		 643 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  36.54 
 
 		 838 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  34.88 
 
 		 253 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  34.68 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  34.45 
 
 		 1168 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  36.19 
 
 		 1873 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  36.63 
 
 		 1321 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  35.29 
 
 		 712 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  30.51 
 
 		 1348 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  32.32 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  40.54 
 
 		 9529 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  41.79 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  36.19 
 
 		 1170 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  36.19 
 
 		 1297 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  34.58 
 
 		 493 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>