85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4656 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  817    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  94.73 
 
 
474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  94.73 
 
 
474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  94.73 
 
 
474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  84.87 
 
 
450 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  78.45 
 
 
423 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  78.69 
 
 
423 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  60.13 
 
 
421 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  60.13 
 
 
421 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  61.59 
 
 
420 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  60.13 
 
 
421 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  60.13 
 
 
421 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  60.13 
 
 
421 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  60.13 
 
 
421 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  60.13 
 
 
421 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  64.26 
 
 
459 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  64.26 
 
 
429 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  67.66 
 
 
278 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  62.2 
 
 
472 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  50.75 
 
 
471 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  65.67 
 
 
274 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  52.17 
 
 
473 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  47.86 
 
 
534 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  47.51 
 
 
533 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  47.48 
 
 
516 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  47.48 
 
 
519 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  47.48 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  45.6 
 
 
635 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  47.57 
 
 
527 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.6 
 
 
484 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  44.32 
 
 
535 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.3 
 
 
478 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  44.58 
 
 
501 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  42.59 
 
 
527 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  43.32 
 
 
409 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  45.75 
 
 
562 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  45.75 
 
 
562 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  43.8 
 
 
427 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  46.25 
 
 
562 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  46.59 
 
 
561 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.45 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.45 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.04 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.09 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.54 
 
 
361 aa  126  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  40.89 
 
 
356 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  40.89 
 
 
356 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  33.66 
 
 
573 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.09 
 
 
385 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  42.2 
 
 
499 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.17 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.18 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  44.29 
 
 
558 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  36.54 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  35.91 
 
 
601 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  34.52 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  35.52 
 
 
354 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.59 
 
 
384 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  38.51 
 
 
408 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.77 
 
 
459 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  36.64 
 
 
584 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  37.72 
 
 
380 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  38.08 
 
 
336 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  38.08 
 
 
336 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  38.08 
 
 
336 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  40 
 
 
389 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  35.58 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  35.38 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  35.38 
 
 
436 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  35.38 
 
 
436 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.98 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  34.43 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  40.91 
 
 
338 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  33.33 
 
 
559 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  32.66 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  33.18 
 
 
903 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  40.8 
 
 
828 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  42.75 
 
 
941 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0977  triple helix repeat-containing collagen  75.36 
 
 
364 aa  60.1  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  32.77 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  44 
 
 
913 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  39.66 
 
 
991 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  44.2 
 
 
667 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  49.57 
 
 
502 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.75 
 
 
269 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>