138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0398 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  100 
 
 
601 aa  980    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  93.81 
 
 
587 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  89.69 
 
 
584 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  93.22 
 
 
354 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  89.43 
 
 
369 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  88.42 
 
 
336 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  88.42 
 
 
336 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  88.42 
 
 
336 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  48.94 
 
 
519 aa  243  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  50 
 
 
534 aa  243  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  49.18 
 
 
533 aa  243  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  48.94 
 
 
516 aa  243  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  48.94 
 
 
517 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  48.73 
 
 
635 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  48.58 
 
 
484 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  56.56 
 
 
338 aa  210  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  45.96 
 
 
527 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  47.75 
 
 
478 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  46.42 
 
 
535 aa  201  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  52.57 
 
 
436 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  52.57 
 
 
436 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  52.21 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  54.67 
 
 
419 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  43.65 
 
 
409 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  45.31 
 
 
527 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  53.22 
 
 
429 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  46.44 
 
 
501 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  49.19 
 
 
561 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  44.32 
 
 
562 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  42.44 
 
 
562 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  42.44 
 
 
562 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  48.95 
 
 
380 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  50.74 
 
 
558 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  42.21 
 
 
427 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  41.32 
 
 
409 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  48.45 
 
 
389 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.43 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  43.1 
 
 
356 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  43.1 
 
 
356 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  42.73 
 
 
408 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.53 
 
 
491 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.53 
 
 
491 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.01 
 
 
354 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.12 
 
 
374 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  40.24 
 
 
421 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  40.24 
 
 
421 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  40.24 
 
 
421 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  40.24 
 
 
421 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  40.24 
 
 
421 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  40.24 
 
 
421 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  40.24 
 
 
421 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  36.3 
 
 
393 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.34 
 
 
384 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  44.8 
 
 
499 aa  124  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  34.54 
 
 
423 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  39.62 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  34.35 
 
 
450 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  36.88 
 
 
278 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  38.03 
 
 
429 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  43.49 
 
 
502 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  37.22 
 
 
274 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  36.48 
 
 
459 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  35.59 
 
 
472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.05 
 
 
370 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.26 
 
 
385 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  35.46 
 
 
473 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  37.92 
 
 
471 aa  107  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  34.75 
 
 
473 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  37.5 
 
 
474 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  37.5 
 
 
474 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  37.5 
 
 
474 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  37.36 
 
 
423 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.5 
 
 
353 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.74 
 
 
361 aa  92.8  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  34.98 
 
 
459 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  34.95 
 
 
835 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  34.15 
 
 
582 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  42.6 
 
 
1580 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  32.68 
 
 
951 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  34.83 
 
 
838 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  33.87 
 
 
835 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  33.53 
 
 
512 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  35.54 
 
 
1873 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  34.48 
 
 
712 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  34.94 
 
 
1297 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  34.25 
 
 
1168 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  34.12 
 
 
1170 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  34.33 
 
 
307 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  34.88 
 
 
835 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.5 
 
 
689 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  30.28 
 
 
1321 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  33.92 
 
 
748 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  34.72 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  31.18 
 
 
473 aa  70.5  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  34.88 
 
 
936 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  31.55 
 
 
706 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  35.21 
 
 
835 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  34.59 
 
 
934 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  34.02 
 
 
1451 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  37.04 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>