142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1081 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  100 
 
 		 587 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  95.36 
 
 		 584 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  93.81 
 
 		 601 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  99.44 
 
 		 354 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  95.39 
 
 		 369 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  94.63 
 
 		 336 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  94.63 
 
 		 336 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  94.63 
 
 		 336 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  56.68 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  49.18 
 
 		 519 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  49.18 
 
 		 516 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  49.18 
 
 		 517 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  48.95 
 
 		 533 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  48.95 
 
 		 534 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  47.1 
 
 		 635 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  47.8 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  56.85 
 
 		 338 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  46.1 
 
 		 535 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.05 
 
 		 478 aa  200  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  43.71 
 
 		 527 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  52.21 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  52.21 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  51.84 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  52.21 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  45.13 
 
 		 527 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  43.38 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  44.41 
 
 		 903 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  44.2 
 
 		 562 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  46.15 
 
 		 501 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  53.22 
 
 		 429 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  48.86 
 
 		 561 aa  170  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  43.24 
 
 		 562 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  43.24 
 
 		 562 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  50.74 
 
 		 558 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  49.12 
 
 		 380 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.64 
 
 		 457 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  39.94 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  41.16 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  48.25 
 
 		 389 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  42.76 
 
 		 356 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  42.76 
 
 		 356 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  42.43 
 
 		 408 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.76 
 
 		 491 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.76 
 
 		 491 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.91 
 
 		 354 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.91 
 
 		 374 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.62 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  35.62 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  44.18 
 
 		 499 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  37.07 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  37.07 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  37.07 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  37.07 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  37.07 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  37.07 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  37.07 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  33.98 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  37.26 
 
 		 278 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.44 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.89 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  33.25 
 
 		 450 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  41.76 
 
 		 420 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  39.13 
 
 		 274 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  38.86 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  38.86 
 
 		 429 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  43.17 
 
 		 502 aa  111  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  36.02 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  38.3 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  39.72 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  36.91 
 
 		 474 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  36.91 
 
 		 474 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  36.91 
 
 		 474 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  37.88 
 
 		 423 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  37.58 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.75 
 
 		 353 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.7 
 
 		 361 aa  97.4  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.85 
 
 		 459 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  35.03 
 
 		 582 aa  87  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  37.74 
 
 		 587 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  35.76 
 
 		 835 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  31.22 
 
 		 842 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  33.09 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  44.03 
 
 		 1580 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  35.4 
 
 		 838 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  32.22 
 
 		 835 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  34.75 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  33.77 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  32.08 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  35.58 
 
 		 1170 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  36.36 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  32.56 
 
 		 706 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  34.64 
 
 		 934 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  34.46 
 
 		 606 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.32 
 
 		 689 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  34.35 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  31.58 
 
 		 1321 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  33.72 
 
 		 582 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  33.98 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  35.5 
 
 		 1451 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  36.47 
 
 		 1873 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>