85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5407 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 409 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  94.7 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  73.41 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  73.41 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  72.68 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  69.73 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  68.32 
 
 		 903 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  46.59 
 
 		 601 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  45.69 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  45.85 
 
 		 587 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  45.85 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  44.42 
 
 		 517 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  44.42 
 
 		 516 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  44.42 
 
 		 519 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  44.06 
 
 		 635 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  44.71 
 
 		 533 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  44.72 
 
 		 584 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  44.47 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  44.47 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  44.47 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  44.47 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  53.46 
 
 		 573 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  42.04 
 
 		 535 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.07 
 
 		 478 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  57.73 
 
 		 338 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  43.32 
 
 		 527 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  43.5 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.36 
 
 		 484 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  42.89 
 
 		 501 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  45.91 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  45.91 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  44.39 
 
 		 427 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  46.42 
 
 		 561 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  41.22 
 
 		 562 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  41.22 
 
 		 562 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  46.24 
 
 		 562 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  45.15 
 
 		 558 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.89 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.89 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.24 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  38.87 
 
 		 459 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  38.87 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  38.87 
 
 		 274 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  42.81 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  36.9 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  41.23 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  43.3 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  38.4 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  35.74 
 
 		 472 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  44.22 
 
 		 502 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  42.46 
 
 		 499 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  36.04 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  35.96 
 
 		 278 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.83 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.21 
 
 		 385 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  41.44 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.31 
 
 		 361 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  31.34 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  33.48 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  35.47 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  32.2 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  35.47 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  35.47 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  35.47 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  35.47 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  35.47 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  35.47 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  36.21 
 
 		 473 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  34.78 
 
 		 423 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  35.02 
 
 		 474 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  35.02 
 
 		 474 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  35.02 
 
 		 474 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.49 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.91 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.08 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.08 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.2 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  35.09 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  32.09 
 
 		 559 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  41.8 
 
 		 828 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  41.8 
 
 		 991 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.84 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  41.27 
 
 		 913 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.93 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0855  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1829 aa  43.9  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.890164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>