83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3565 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 429 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  94.7 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  73.17 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  73.17 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  72.93 
 
 		 436 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  69.49 
 
 		 419 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  69.05 
 
 		 903 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  46.5 
 
 		 601 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  46.34 
 
 		 587 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  46.15 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  43.97 
 
 		 584 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  43.21 
 
 		 516 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  43.21 
 
 		 519 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  43.21 
 
 		 517 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  46.32 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  43.69 
 
 		 534 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  43.47 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  42.89 
 
 		 635 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  53.22 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  43.34 
 
 		 336 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  43.34 
 
 		 336 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  43.34 
 
 		 336 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  48.01 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  47.48 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  41.18 
 
 		 535 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  45.45 
 
 		 527 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  43.45 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  45.55 
 
 		 561 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 356 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 356 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  41.47 
 
 		 501 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  42.13 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  45.91 
 
 		 562 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  45.91 
 
 		 562 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  45.91 
 
 		 562 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.78 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  45.04 
 
 		 558 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  37.68 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  37.68 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  36.07 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  38.06 
 
 		 274 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  36.95 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  42.31 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  32.35 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  42.24 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.32 
 
 		 361 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  35.25 
 
 		 420 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  43.08 
 
 		 502 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  42.18 
 
 		 499 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  33.33 
 
 		 473 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  35.86 
 
 		 278 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  34.84 
 
 		 450 aa  97.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.92 
 
 		 384 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  36.07 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.28 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  34.44 
 
 		 409 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  35.25 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  35.25 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  35.25 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  45.41 
 
 		 338 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  37.23 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.54 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  39.88 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.28 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.71 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.71 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  38.75 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.8 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  35.67 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  32.07 
 
 		 559 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.84 
 
 		 249 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.46 
 
 		 269 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  38.36 
 
 		 991 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  38.36 
 
 		 828 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>