142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4455 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 459 aa  794    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  99.27 
 
 		 274 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  77 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  80.15 
 
 		 278 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  64.66 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  58.11 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  65.18 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  65.18 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  65.18 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  63.49 
 
 		 473 aa  273  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  56.76 
 
 		 423 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  55.37 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  56.23 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  52.36 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  50.74 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.45 
 
 		 484 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.76 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  39.12 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 516 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  43.15 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  37.86 
 
 		 533 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  37.86 
 
 		 635 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.83 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.83 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  45.24 
 
 		 562 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  45.24 
 
 		 562 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  45.24 
 
 		 562 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  43.81 
 
 		 558 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.04 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  36.07 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  36.42 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  40.71 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.62 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  41.43 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  37.12 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  42.19 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  38.43 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  36.73 
 
 		 601 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.09 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  40.44 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  40.44 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  40.44 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  40.95 
 
 		 501 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.09 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  38.7 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  36.23 
 
 		 584 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 336 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 336 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 336 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1408 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  38.5 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  36.99 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39 
 
 		 361 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.5 
 
 		 370 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  39.22 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  41.31 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  40.22 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.47 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  41.78 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  34.04 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.43 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  34.27 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  40.56 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  34.51 
 
 		 813 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  37.04 
 
 		 587 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  43.57 
 
 		 1580 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.58 
 
 		 689 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  36.76 
 
 		 835 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  34.78 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  34.04 
 
 		 643 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  35.29 
 
 		 838 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  34.72 
 
 		 582 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  35.71 
 
 		 1873 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  33.58 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  36.36 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.18 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  34.07 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  37.5 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  35.65 
 
 		 903 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  34.72 
 
 		 1321 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  34.85 
 
 		 712 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  35.56 
 
 		 1297 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  34.23 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  34.38 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  33.77 
 
 		 1168 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  34.06 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  33.77 
 
 		 1451 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  34.65 
 
 		 706 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  34.72 
 
 		 936 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>