90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4657 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  100 
 
 
558 aa  929    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  91.48 
 
 
562 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  91.48 
 
 
562 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  91.31 
 
 
562 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  84.58 
 
 
561 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  77.21 
 
 
527 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  66.45 
 
 
501 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  60.84 
 
 
519 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  60.84 
 
 
517 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  60.84 
 
 
516 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  57.63 
 
 
534 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  57.75 
 
 
533 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  57.51 
 
 
635 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  67.95 
 
 
535 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  54.26 
 
 
484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  54.5 
 
 
478 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  55.37 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  58.54 
 
 
502 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  45.03 
 
 
587 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  44.64 
 
 
601 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  47.02 
 
 
369 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  55.59 
 
 
408 aa  200  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  56.04 
 
 
389 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  45.35 
 
 
354 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  48.41 
 
 
584 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  46.08 
 
 
573 aa  193  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.86 
 
 
457 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  48.51 
 
 
427 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  49.34 
 
 
474 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  49.34 
 
 
474 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  49.34 
 
 
474 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.06 
 
 
491 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.06 
 
 
491 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  42.6 
 
 
450 aa  174  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  48.84 
 
 
336 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  48.84 
 
 
336 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  48.84 
 
 
336 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  48.99 
 
 
356 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  48.99 
 
 
356 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  44.79 
 
 
420 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  43.97 
 
 
409 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  43.4 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  43.4 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  43.4 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  43.4 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  43.4 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  43.4 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  43.4 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  46.46 
 
 
473 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  40.95 
 
 
423 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  42.34 
 
 
423 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.34 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  47.24 
 
 
370 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  47.04 
 
 
385 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  42.98 
 
 
429 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  42.98 
 
 
459 aa  144  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.16 
 
 
374 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.57 
 
 
354 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  44.59 
 
 
278 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  40.42 
 
 
393 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  43.04 
 
 
274 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  40.15 
 
 
471 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  42.7 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  42.7 
 
 
436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  42.7 
 
 
436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  45.58 
 
 
419 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  48.29 
 
 
429 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  40.15 
 
 
409 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.56 
 
 
459 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  47.06 
 
 
338 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.44 
 
 
361 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  40.73 
 
 
473 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  37.14 
 
 
472 aa  123  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  40.26 
 
 
903 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  50 
 
 
353 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  37.03 
 
 
1860 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  43.85 
 
 
941 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  39.53 
 
 
991 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  42.39 
 
 
913 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  37.31 
 
 
559 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  37.82 
 
 
667 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  37.86 
 
 
828 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0977  triple helix repeat-containing collagen  75.76 
 
 
364 aa  62  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  31.44 
 
 
458 aa  60.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.67 
 
 
269 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.23 
 
 
249 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3039  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  48.1 
 
 
269 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1249  hypothetical protein  58.62 
 
 
405 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  37.5 
 
 
639 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  57.69 
 
 
499 aa  43.5  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>