84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2833 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  95.39 
 
 
587 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  95.39 
 
 
354 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  91.06 
 
 
336 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  91.06 
 
 
336 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  91.06 
 
 
336 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  90.79 
 
 
584 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  89.43 
 
 
601 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  56.06 
 
 
573 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  53.75 
 
 
534 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  53.63 
 
 
533 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  53.15 
 
 
516 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  53.15 
 
 
519 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  53.15 
 
 
517 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  52.11 
 
 
635 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  57.51 
 
 
338 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  48.12 
 
 
535 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  46.29 
 
 
527 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.99 
 
 
484 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  55.16 
 
 
436 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  55.16 
 
 
436 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  54.71 
 
 
436 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.3 
 
 
478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  54.46 
 
 
419 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  44.23 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  46.46 
 
 
527 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  45.89 
 
 
562 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  45.89 
 
 
562 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  44.81 
 
 
562 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  47.06 
 
 
501 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  53.21 
 
 
429 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  47.4 
 
 
903 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  45.45 
 
 
561 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  45.11 
 
 
558 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.39 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  40.45 
 
 
427 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  44.86 
 
 
356 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  44.86 
 
 
356 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  50.92 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  40.33 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  50.68 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.77 
 
 
491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.77 
 
 
491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  39 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  44.65 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  43.81 
 
 
408 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.79 
 
 
385 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.95 
 
 
374 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.26 
 
 
354 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  37.65 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  37.65 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  37.65 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  37.65 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  37.65 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  37.65 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  37.65 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  33.42 
 
 
450 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  40.1 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  40.1 
 
 
459 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  40.1 
 
 
274 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  37.89 
 
 
393 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  46.32 
 
 
502 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  39.94 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.77 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  39.77 
 
 
423 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  34.56 
 
 
278 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  36.41 
 
 
472 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.81 
 
 
384 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  33.81 
 
 
474 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  33.81 
 
 
474 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  33.81 
 
 
474 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  35.17 
 
 
473 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  37.6 
 
 
471 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  37.64 
 
 
473 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.48 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.03 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.83 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  35.2 
 
 
559 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  35.12 
 
 
458 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.53 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.99 
 
 
805 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.63 
 
 
249 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0855  hypothetical protein  26.07 
 
 
1829 aa  44.3  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.890164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3039  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.23 
 
 
269 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>