91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0395 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  100 
 
 		 478 aa  826    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  55.22 
 
 		 534 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  53.75 
 
 		 533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  53.23 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  53.23 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  53.23 
 
 		 517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  52.97 
 
 		 635 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  52.71 
 
 		 535 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  47.33 
 
 		 601 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  47.83 
 
 		 527 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  45.5 
 
 		 587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  50 
 
 		 501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  49.63 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  51.96 
 
 		 562 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  51.96 
 
 		 562 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  53.11 
 
 		 561 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  46.92 
 
 		 584 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  51.7 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  46.48 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  52.04 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  54.59 
 
 		 558 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  48.03 
 
 		 573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  45.32 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  48.37 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  43.84 
 
 		 409 aa  177  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  47.79 
 
 		 336 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  47.79 
 
 		 336 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  47.79 
 
 		 336 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  46.6 
 
 		 356 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  46.6 
 
 		 356 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.89 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.22 
 
 		 354 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.22 
 
 		 374 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  47.54 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  43.09 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  48.62 
 
 		 389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  39.36 
 
 		 420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  53.41 
 
 		 502 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.66 
 
 		 384 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  43.72 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  43.72 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  43.72 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  42.78 
 
 		 471 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  37.8 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  41.85 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  44.8 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  51.49 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.34 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  51.49 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  51.49 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.82 
 
 		 491 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.82 
 
 		 491 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  39.56 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  53.2 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  38.83 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  38.83 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  38.83 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  38.83 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  38.83 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  38.83 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  38.83 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  42.71 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  49.06 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.84 
 
 		 457 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  48.78 
 
 		 903 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  48.47 
 
 		 409 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  36.59 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  36.59 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  37.45 
 
 		 472 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  38.53 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  38.27 
 
 		 278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.88 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  36.46 
 
 		 274 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  51.34 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.5 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.23 
 
 		 353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  32.02 
 
 		 559 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  32.35 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  93.1 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  50 
 
 		 249 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  42.86 
 
 		 941 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  36 
 
 		 667 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.38 
 
 		 269 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0977  triple helix repeat-containing collagen  43.98 
 
 		 364 aa  54.7  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1860 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  40.49 
 
 		 828 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  40.49 
 
 		 991 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  42.25 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  65 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  57.78 
 
 		 628 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.42 
 
 		 408 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>