79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0158 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  100 
 
 
421 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  100 
 
 
421 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  100 
 
 
421 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  100 
 
 
421 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  100 
 
 
421 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  100 
 
 
421 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  100 
 
 
421 aa  736    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  93.13 
 
 
420 aa  584  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  61.66 
 
 
450 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  63.13 
 
 
423 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  63.13 
 
 
423 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  59.62 
 
 
474 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  59.62 
 
 
474 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  59.62 
 
 
474 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  66.24 
 
 
278 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  60.48 
 
 
459 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  60.48 
 
 
429 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  50.48 
 
 
471 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  57.48 
 
 
472 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  62.5 
 
 
274 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  49.29 
 
 
473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  46.11 
 
 
534 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  44.72 
 
 
519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  44.72 
 
 
516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  44.72 
 
 
517 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  45.83 
 
 
533 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  45.28 
 
 
635 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.85 
 
 
484 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  45.14 
 
 
527 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  44.44 
 
 
535 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  42.38 
 
 
427 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.12 
 
 
478 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.73 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.73 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  39.82 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  40.27 
 
 
356 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  40.27 
 
 
356 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  40.46 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  39.13 
 
 
527 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  41.03 
 
 
561 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  41.23 
 
 
562 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  41.23 
 
 
562 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  41.16 
 
 
562 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  37.23 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.62 
 
 
384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  36.6 
 
 
601 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.32 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  37.8 
 
 
354 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.46 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  36.76 
 
 
587 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  41.39 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  32.23 
 
 
573 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.98 
 
 
457 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  43.52 
 
 
408 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.77 
 
 
361 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  40.98 
 
 
389 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  34.26 
 
 
374 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.46 
 
 
354 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  40.38 
 
 
558 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.74 
 
 
459 aa  99.8  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  39.15 
 
 
336 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  39.15 
 
 
336 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  39.15 
 
 
336 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  37.6 
 
 
584 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  42.99 
 
 
502 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  38.35 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  39.54 
 
 
499 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  37.44 
 
 
436 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  37.44 
 
 
436 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  37.44 
 
 
436 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  42.7 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.3 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  36.89 
 
 
559 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  33.33 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  33.5 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  37.19 
 
 
903 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  30.77 
 
 
458 aa  56.6  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.11 
 
 
269 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.24 
 
 
249 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>