144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5047 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 
903 aa  1391    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  79.82 
 
 
436 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  79.82 
 
 
436 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  70.4 
 
 
436 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  78.32 
 
 
419 aa  289  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  80.34 
 
 
429 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  80 
 
 
409 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  47.49 
 
 
601 aa  212  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  49.39 
 
 
584 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  45.82 
 
 
587 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  48.43 
 
 
369 aa  191  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  46.93 
 
 
354 aa  187  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  39.61 
 
 
573 aa  184  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  42.44 
 
 
517 aa  183  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  42.23 
 
 
519 aa  183  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  42.23 
 
 
516 aa  183  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  42.5 
 
 
533 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  42.5 
 
 
534 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  48.32 
 
 
336 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  48.32 
 
 
336 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  48.32 
 
 
336 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.05 
 
 
484 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  43.27 
 
 
635 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.1 
 
 
478 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  41.71 
 
 
527 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  57.73 
 
 
338 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  40.51 
 
 
535 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  41.18 
 
 
427 aa  124  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  34.12 
 
 
835 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  33.46 
 
 
842 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  34.5 
 
 
1170 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  34.3 
 
 
951 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  33.96 
 
 
512 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  32.26 
 
 
835 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  34.22 
 
 
712 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  34.12 
 
 
835 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  39.53 
 
 
527 aa  118  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  46.64 
 
 
561 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  32.18 
 
 
813 aa  115  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  40.21 
 
 
1580 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  33.89 
 
 
1297 aa  115  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.81 
 
 
457 aa  114  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  34.73 
 
 
838 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  33.96 
 
 
1168 aa  110  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  32.42 
 
 
1321 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  33.73 
 
 
748 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  34.22 
 
 
934 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  34.7 
 
 
936 aa  108  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  33.46 
 
 
835 aa  108  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  30.32 
 
 
643 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  35.59 
 
 
393 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  33.96 
 
 
1147 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  38.2 
 
 
473 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  40.26 
 
 
356 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  40.26 
 
 
356 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  29.73 
 
 
585 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  39.03 
 
 
501 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  42.52 
 
 
380 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.61 
 
 
491 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  32.5 
 
 
706 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.61 
 
 
491 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  35.28 
 
 
409 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  45.56 
 
 
558 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  32.73 
 
 
542 aa  99.4  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  37.85 
 
 
471 aa  99.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  35.78 
 
 
562 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  38.38 
 
 
562 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  38.38 
 
 
562 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  31.98 
 
 
450 aa  95.5  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  37.4 
 
 
472 aa  94  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  29.7 
 
 
867 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  37.61 
 
 
278 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  41.11 
 
 
389 aa  90.1  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.85 
 
 
384 aa  89.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  37.39 
 
 
274 aa  89.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  33.6 
 
 
1451 aa  88.2  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  33.68 
 
 
423 aa  88.2  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  40.78 
 
 
499 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  35.16 
 
 
459 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  35.16 
 
 
429 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  36.9 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.64 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  32.71 
 
 
462 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.97 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.96 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  35.83 
 
 
421 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  35.83 
 
 
421 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  35.83 
 
 
421 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  35.83 
 
 
421 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  35.83 
 
 
421 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  35.83 
 
 
421 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  35.83 
 
 
421 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.32 
 
 
2914 aa  79.7  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  34.76 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  38.08 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  32.68 
 
 
606 aa  77.8  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.57 
 
 
689 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.03 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  35.68 
 
 
444 aa  74.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  34.53 
 
 
307 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>