77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2805 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  100 
 
 
473 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  82.57 
 
 
471 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  48.89 
 
 
421 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  48.89 
 
 
421 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  48.89 
 
 
421 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  48.89 
 
 
421 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  48.89 
 
 
421 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  48.89 
 
 
421 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  48.89 
 
 
421 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  48.78 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  55.03 
 
 
474 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  55.03 
 
 
474 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  59.51 
 
 
473 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  55.03 
 
 
474 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  54.55 
 
 
423 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  54.72 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  58.3 
 
 
278 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  49.43 
 
 
472 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  52.21 
 
 
429 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  52.21 
 
 
459 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  54.51 
 
 
274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  50.6 
 
 
393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  39.36 
 
 
534 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  39.85 
 
 
533 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  39.12 
 
 
517 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  39.12 
 
 
519 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  39.5 
 
 
635 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.97 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.4 
 
 
484 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  38.56 
 
 
535 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  38.31 
 
 
527 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  44.93 
 
 
419 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  45.21 
 
 
562 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  45.21 
 
 
562 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  46.19 
 
 
562 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  45.24 
 
 
561 aa  120  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  43.69 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  44.76 
 
 
558 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  43.2 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  43.2 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  39.38 
 
 
573 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.03 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.2 
 
 
491 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.2 
 
 
491 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  37.18 
 
 
601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  42.36 
 
 
501 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  38.52 
 
 
354 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  35.69 
 
 
427 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  38.02 
 
 
369 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  38.36 
 
 
356 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  38.36 
 
 
356 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  42.86 
 
 
527 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  37.91 
 
 
380 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  40.76 
 
 
389 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.11 
 
 
374 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  38.61 
 
 
408 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  40.98 
 
 
429 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  37.17 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.44 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  41.12 
 
 
409 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  46.12 
 
 
502 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.47 
 
 
384 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  34.6 
 
 
587 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  34.65 
 
 
584 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.54 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  43.6 
 
 
338 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.77 
 
 
385 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  40.28 
 
 
903 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  35.18 
 
 
336 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  35.18 
 
 
336 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  35.18 
 
 
336 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.4 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.31 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  37.25 
 
 
559 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.45 
 
 
269 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.05 
 
 
249 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3039  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.24 
 
 
269 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>