75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4172 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 472 aa  822    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  62.86 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  66.54 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  66.54 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  66.39 
 
 		 274 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  64.58 
 
 		 278 aa  279  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  61.11 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  62.15 
 
 		 474 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  62.15 
 
 		 474 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  62.15 
 
 		 474 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  61.9 
 
 		 473 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  60.8 
 
 		 423 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  60.24 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  54.46 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  53.44 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  53.44 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  53.44 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  53.44 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  53.44 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  53.44 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  53.44 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  50.2 
 
 		 471 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  50.2 
 
 		 473 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 573 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.56 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.21 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  39.76 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  39.76 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  39.76 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  35.55 
 
 		 601 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.41 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.41 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 587 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  37.58 
 
 		 527 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  39.56 
 
 		 356 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  39.56 
 
 		 356 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  38.46 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  37.79 
 
 		 535 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  36.65 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  37.38 
 
 		 369 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  35.74 
 
 		 584 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  36.45 
 
 		 419 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  36.49 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  36.49 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.2 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  33.06 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  36.49 
 
 		 436 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  37.37 
 
 		 429 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  36.28 
 
 		 336 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  36.28 
 
 		 336 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  36.28 
 
 		 336 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  36.64 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.4 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.46 
 
 		 370 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.4 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  36.96 
 
 		 389 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  40.22 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  35.87 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.44 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  31.15 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  36.84 
 
 		 903 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.74 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  35.08 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  34.38 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  38.98 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  48.04 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.19 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  42.86 
 
 		 559 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  41.79 
 
 		 164 aa  50.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30195  hypothetical protein, likely cell wall localized and GPI-anchored mucin like  51.25 
 
 		 812 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.322783 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  44.93 
 
 		 1034 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  39 
 
 		 844 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  39 
 
 		 847 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  39 
 
 		 847 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38100  predicted protein  32 
 
 		 133 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>