138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0090 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  100 
 
 
584 aa  949    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  95.36 
 
 
587 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  99.7 
 
 
336 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  99.7 
 
 
336 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  99.7 
 
 
336 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  89.69 
 
 
601 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  94.35 
 
 
354 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  90.79 
 
 
369 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  48.33 
 
 
519 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  48.33 
 
 
516 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  48.33 
 
 
517 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  48.1 
 
 
533 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  47.42 
 
 
534 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  49.32 
 
 
635 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  48.13 
 
 
484 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  55.85 
 
 
338 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  45.92 
 
 
535 aa  189  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.99 
 
 
478 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  52.06 
 
 
436 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  52.06 
 
 
436 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  51.69 
 
 
436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  45.48 
 
 
527 aa  178  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  56.4 
 
 
903 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  52.06 
 
 
419 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  52.36 
 
 
429 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  52.51 
 
 
409 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.44 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  49.29 
 
 
561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  43.63 
 
 
501 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  41.8 
 
 
527 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  47.86 
 
 
380 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  39.09 
 
 
427 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  52.07 
 
 
558 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  40.76 
 
 
409 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  47.06 
 
 
389 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  42.41 
 
 
408 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.58 
 
 
354 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.58 
 
 
374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.05 
 
 
384 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  35.94 
 
 
393 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.83 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.83 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  37.34 
 
 
473 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  38.74 
 
 
278 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  36.83 
 
 
420 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  34.82 
 
 
450 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  36.29 
 
 
274 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  36.12 
 
 
459 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  36.12 
 
 
429 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  41.79 
 
 
499 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  38.68 
 
 
471 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  36.34 
 
 
421 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  36.34 
 
 
421 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  36.34 
 
 
421 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  36.34 
 
 
421 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  36.34 
 
 
421 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  36.34 
 
 
421 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  36.34 
 
 
421 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  37.06 
 
 
423 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.42 
 
 
353 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  39.45 
 
 
473 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  37.65 
 
 
423 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.08 
 
 
370 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  44.37 
 
 
502 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  34.88 
 
 
582 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  35.56 
 
 
835 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  31.36 
 
 
842 aa  94.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  36.29 
 
 
474 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  36.29 
 
 
474 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  36.29 
 
 
474 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  36.84 
 
 
587 aa  91.3  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  32.86 
 
 
344 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  35.33 
 
 
838 aa  87  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.86 
 
 
385 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.16 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  41.28 
 
 
1580 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  33.73 
 
 
512 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  35.09 
 
 
1170 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  35 
 
 
835 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  32.62 
 
 
706 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.92 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  34.75 
 
 
307 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  34.68 
 
 
835 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  33.55 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  34.53 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  34.07 
 
 
582 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  36.36 
 
 
542 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  33.74 
 
 
606 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  33.96 
 
 
934 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.09 
 
 
689 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  34.13 
 
 
356 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  34.13 
 
 
356 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  34.44 
 
 
1321 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  33.18 
 
 
300 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  34.71 
 
 
1297 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  35.1 
 
 
867 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  34.88 
 
 
1451 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  35.06 
 
 
951 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  29.33 
 
 
1873 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  29.41 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>