79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02599 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  100 
 
 		 353 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  65.6 
 
 		 374 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  66.01 
 
 		 354 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  49.08 
 
 		 427 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  45.38 
 
 		 409 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  49.85 
 
 		 527 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  51.67 
 
 		 491 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  51.67 
 
 		 491 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  47.43 
 
 		 635 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  47.29 
 
 		 533 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  47.15 
 
 		 534 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  46.27 
 
 		 519 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  46.27 
 
 		 516 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  46.69 
 
 		 517 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  50.17 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  50.17 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.93 
 
 		 457 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.6 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  45.36 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.3 
 
 		 384 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.35 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  45.9 
 
 		 501 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  48.32 
 
 		 561 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.9 
 
 		 370 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  45.9 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  51.74 
 
 		 459 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.57 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  42.03 
 
 		 601 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  44 
 
 		 562 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.67 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  44 
 
 		 562 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  41.22 
 
 		 587 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  47.65 
 
 		 558 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  45.4 
 
 		 562 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  46.79 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  38.51 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  37.75 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  40 
 
 		 389 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 584 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  37.61 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  42.55 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  42.92 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  42.06 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  42.06 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  41.67 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  42.06 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  38.6 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  40.23 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  38.01 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  39.17 
 
 		 573 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  41.25 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  37.59 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  37.59 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  39.92 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  39.92 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  39.92 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  40.06 
 
 		 502 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  37.09 
 
 		 274 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  36.58 
 
 		 471 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  37.04 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  36.68 
 
 		 473 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  43.29 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  43.72 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  41.58 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  39.92 
 
 		 903 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  40.3 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  40.3 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  40.3 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  41.46 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  35.42 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  31.52 
 
 		 559 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.47 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>