53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2796 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  100 
 
 		 249 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  56.33 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3039  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  59.02 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.5 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  42.38 
 
 		 635 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  44.2 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  44.2 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  44.2 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  44.2 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  40.58 
 
 		 535 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  44.2 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  47.86 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  47.86 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  44.88 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  50 
 
 		 478 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.76 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  40.12 
 
 		 527 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  44.3 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  44.3 
 
 		 527 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  55.17 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  43.75 
 
 		 559 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  45.57 
 
 		 562 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  45.57 
 
 		 558 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  45.57 
 
 		 562 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  45.57 
 
 		 562 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  45.57 
 
 		 561 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  36.63 
 
 		 356 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  36.63 
 
 		 356 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  41.77 
 
 		 408 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  41.07 
 
 		 389 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  43.04 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  40.91 
 
 		 473 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  34.35 
 
 		 587 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  34.35 
 
 		 354 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  49.37 
 
 		 499 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  39.22 
 
 		 471 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  40.58 
 
 		 409 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  43.55 
 
 		 502 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.06 
 
 		 384 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  47.17 
 
 		 385 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  44.23 
 
 		 584 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  39.86 
 
 		 429 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  44.23 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  44.23 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  44.23 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  34.85 
 
 		 601 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  34.53 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  36.11 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0855  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1829 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.890164  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  36.84 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  37.97 
 
 		 573 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.35 
 
 		 374 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.35 
 
 		 354 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>