87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1936 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  96.71 
 
 		 517 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  96.71 
 
 		 519 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1141    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  90.38 
 
 		 535 aa  545  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  58.06 
 
 		 562 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  58.06 
 
 		 562 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  60.74 
 
 		 527 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  57.36 
 
 		 562 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  58.12 
 
 		 501 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  57.58 
 
 		 561 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  55.01 
 
 		 527 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  58.89 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  52.6 
 
 		 478 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  59.23 
 
 		 502 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  51.5 
 
 		 369 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  47.55 
 
 		 587 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  49.65 
 
 		 601 aa  234  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  48.87 
 
 		 354 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  46.45 
 
 		 584 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  53.07 
 
 		 380 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  59.04 
 
 		 389 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  47.45 
 
 		 336 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  47.45 
 
 		 336 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  47.45 
 
 		 336 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  55.05 
 
 		 408 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  46.18 
 
 		 427 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  52.5 
 
 		 491 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  52.5 
 
 		 491 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  48.36 
 
 		 356 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  48.36 
 
 		 356 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  44.72 
 
 		 573 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.32 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  44.66 
 
 		 420 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  43.23 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  43.94 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  43.94 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  43.94 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  44.91 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.91 
 
 		 374 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.62 
 
 		 354 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  44.48 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.75 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.94 
 
 		 384 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  39.61 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  40.4 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  44.94 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  44.94 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  44.57 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  39.74 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.39 
 
 		 370 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  50.96 
 
 		 353 aa  143  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  41.45 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  41.53 
 
 		 278 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  40.27 
 
 		 429 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  39.53 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.72 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  45.09 
 
 		 419 aa  137  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  40.24 
 
 		 429 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  43.77 
 
 		 338 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  40.24 
 
 		 459 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  36.73 
 
 		 393 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  39.83 
 
 		 274 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  38.71 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.9 
 
 		 361 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  38.78 
 
 		 903 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  36.06 
 
 		 559 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.15 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.29 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0977  triple helix repeat-containing collagen  72.6 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 991 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  35.26 
 
 		 913 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  37.56 
 
 		 1860 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  35.11 
 
 		 828 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  29.84 
 
 		 458 aa  55.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  38.12 
 
 		 941 aa  54.3  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  79.31 
 
 		 558 aa  50.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  42.37 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>