23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01904 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  100 
 
 		 667 aa  1117    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  57.98 
 
 		 1860 aa  357  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  48.04 
 
 		 913 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  43.88 
 
 		 991 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  45.94 
 
 		 828 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  44.79 
 
 		 941 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1866  hypothetical protein  33.38 
 
 		 668 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2740  hypothetical protein  33.38 
 
 		 668 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3158  hypothetical protein  32.97 
 
 		 689 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3178  hypothetical protein  34.09 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110039  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3121  hypothetical protein  36.87 
 
 		 497 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1438  hypothetical protein  33.66 
 
 		 460 aa  87.8  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0908  hypothetical protein  36.01 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  34.71 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  40.6 
 
 		 516 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  40.6 
 
 		 533 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  40.6 
 
 		 519 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6354  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1166 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00361668  normal  0.829554 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  40.6 
 
 		 517 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6766  PE-PGRS family protein  31.71 
 
 		 1435 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.682763  normal  0.803816 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6532  PE-PGRS family protein  31.71 
 
 		 1435 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  37.31 
 
 		 527 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  39.85 
 
 		 635 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>